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austin2008

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 能在芽孢杆菌中复制的温敏型复制子194ts片段连接T载体多次测序都发生突变 已有1人参与

问题描述:本人想构建一个温敏型的穿梭质粒,在NCBI上找到pE194质粒上的复制子序列194ts(GenBank: M17811.1),然后送到苏州某公司合成1138 bp 的片段,结果该公司两次装载pUC57载体失败,主要是原因是,这个片段装到pUC57载体中总是发生各种突变,他们测序了7个克隆子后测序发现2个双峰,5个突变,而且每个突变的突变位置都不一样,最终提供给我们的是合成的组装好的PCR产物和空的pUC57载体,给我们的解释是我们合成的194ts片段是个复制子可能会与载体上大肠杆菌的ori发生冲突,复制过程中产生突变。我当时对这个解释是将信将疑,等拿到材料了准备验证一下,无论是我们连接pMD19T simple载体还是pUC57载体,做了3次,每次送3-4个阳性克隆子去测序,结果每次都有突变,而且每次突变的点不一样,我们将这些突变的温敏复制子酶切后,连入穿梭载体替换芽孢杆菌的复制区域,发现转化2次枯草芽孢杆菌,每一种都没有长出阳性克隆子(注:对照质粒转化长了,枯草芽孢杆菌感受态细胞没问题)。
      我个人分析了一下,可能有以下2种原因:(1)这个温敏型复制子194ts连入T载体质粒不稳定,可能是连入的方向不好;(2)大肠杆菌的ori和这个194ts片段在一个载体中时在质粒复制过程中出现问题;问了好些做分子生物学的人都不知道其中出了什么问题,请了解情况的高手赐教,不胜感激……!
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优秀是一种习惯;生命是一种过程;放弃是一种智慧;缺点是一种恩惠!
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weishengsu5

木虫 (正式写手)

请教,您这个温敏型的穿梭质粒后来构建成功了吗?
5楼2015-01-08 17:06:42
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huangrui1988

铜虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
austin2008: 金币+3, 有帮助, 好的,我看看文献去,但是那些突变是不影响复制功能的呢? 2014-06-12 23:44:43
你看了pE194质粒的相关文章就会发现,他本来自己就是会突变的,包括移码突变。。。
2楼2014-06-12 22:48:51
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austin2008

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huangrui1988 at 2014-06-12 22:48:51
你看了pE194质粒的相关文章就会发现,他本来自己就是会突变的,包括移码突变。。。

那怎么知道那些突变是不影响功能的呢?
优秀是一种习惯;生命是一种过程;放弃是一种智慧;缺点是一种恩惠!
3楼2014-06-12 23:42:48
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huangrui1988

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by austin2008 at 2014-06-12 23:42:48
那怎么知道那些突变是不影响功能的呢?...

随机的。。。。你看看对你的实验有没有影响就知道啦。
4楼2014-06-13 00:02:40
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