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C_X_L

金虫 (小有名气)

[求助] 希望研究团簇的高人给指点一下初始结构的问题 已有2人参与

比如说原子数目确定了,团簇的初始结构是如何产生的,貌似有很多结构都可以作为初始结构?如是随机产生是不是首先选取多种对称性,在对称性确定的基础上随机得到多种结构,然后进一步优化,最后确定稳定结构?
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求知求解
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看你想研究什么团簇了,氧化物,分子筛
2楼2014-06-10 14:53:50
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C_X_L

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wangsihang at 2014-06-10 14:53:50
看你想研究什么团簇了,氧化物,分子筛

打个比方吧,如果一个团簇由20个Fe原子构成,这样构成的结构肯定很多很多,在确定初始结构时候如果是“随机”选取是怎样取,是先确定几种对称性,然后在这几种对称性条件下随机取,然后优化结构。还是不用考虑对称性,就是随便选取,再优化结构。
求知求解
3楼2014-06-11 08:52:06
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

我不做这个,不过从看到的文献情况来看,一类如你所说是对称性高的,另外还有就是从金属表面挖(切)下来的。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-06-11 11:28:41
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
C_X_L: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-06-16 11:05:08
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5楼2014-06-12 10:52:21
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C_X_L

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2014-06-12 10:52:21
做团簇的研究时初始结构的选取非常重要,因为ab initio的优化只会优化到局部极小点,尽可能地选取更多的结构来进行优化才有可能得到“全局”极小,但事实上对于较大的团簇,没有人可以拍着胸膛讲哪一个是全局极小结 ...

我一般都是看文献,用别人得到的结构为对象用GS进一步计算,这样合适吗?
求知求解
6楼2014-06-12 20:59:16
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匿名

用户注销 (正式写手)

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7楼2014-06-13 09:10:07
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C_X_L

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2014-06-13 09:10:07
如果是比较成熟的体系,大家公认的全局极小点没有太多争议,那么就没有问题。
...

是这样的,我一般是用别人的得到的稳定结构当做我的初始结构,然后用opt等关键词加上其他关键词算数据,但是有这样一个问题,我的算法可能和别人不一样。比方说作者是用pbepbe得到的稳定结构,而我用b3lyp算法对这个稳定结构进一步用opt关键词进行优化,这样合适吗?
求知求解
8楼2014-06-14 23:25:08
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匿名

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9楼2014-06-15 00:53:55
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