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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 希望研究团簇的高人给指点一下初始结构的问题
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C_X_L

金虫 (小有名气)

雪

[求助] 希望研究团簇的高人给指点一下初始结构的问题 已有2人参与

比如说原子数目确定了，团簇的初始结构是如何产生的，貌似有很多结构都可以作为初始结构？如是随机产生是不是首先选取多种对称性，在对称性确定的基础上随机得到多种结构，然后进一步优化，最后确定稳定结构？
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求知求解
1楼 2014-06-10 14:33:58
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看你想研究什么团簇了，氧化物，分子筛
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2楼2014-06-10 14:53:50
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C_X_L

金虫 (小有名气)

雪
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangsihang at 2014-06-10 14:53:50
看你想研究什么团簇了，氧化物，分子筛

打个比方吧，如果一个团簇由20个Fe原子构成，这样构成的结构肯定很多很多，在确定初始结构时候如果是“随机”选取是怎样取，是先确定几种对称性，然后在这几种对称性条件下随机取，然后优化结构。还是不用考虑对称性，就是随便选取，再优化结构。
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求知求解
3楼2014-06-11 08:52:06
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
我不做这个，不过从看到的文献情况来看，一类如你所说是对称性高的，另外还有就是从金属表面挖（切）下来的。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-06-11 11:28:41
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匿名

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
C_X_L: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-06-16 11:05:08
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5楼2014-06-12 10:52:21
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C_X_L

金虫 (小有名气)

雪
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2014-06-12 10:52:21
做团簇的研究时初始结构的选取非常重要，因为ab initio的优化只会优化到局部极小点，尽可能地选取更多的结构来进行优化才有可能得到“全局”极小，但事实上对于较大的团簇，没有人可以拍着胸膛讲哪一个是全局极小结 ...

我一般都是看文献，用别人得到的结构为对象用GS进一步计算，这样合适吗？
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求知求解
6楼2014-06-12 20:59:16
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匿名

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7楼2014-06-13 09:10:07
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C_X_L

金虫 (小有名气)

雪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2014-06-13 09:10:07
如果是比较成熟的体系，大家公认的全局极小点没有太多争议，那么就没有问题。
...

是这样的，我一般是用别人的得到的稳定结构当做我的初始结构，然后用opt等关键词加上其他关键词算数据，但是有这样一个问题，我的算法可能和别人不一样。比方说作者是用pbepbe得到的稳定结构，而我用b3lyp算法对这个稳定结构进一步用opt关键词进行优化，这样合适吗？
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求知求解
8楼2014-06-14 23:25:08
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匿名

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9楼2014-06-15 00:53:55
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