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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于分子进化
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sxyhelen

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于分子进化 已有3人参与

最近在做分子系统进化方面的实验，得到序列信息之后不知道该从哪些方面进行分析。有木有知道进行分子进化分析的软件都有哪些？只是简单算了下分化时间，但是没有找到化石数据校准，所以也不晓得算的对不对。纠结
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1楼 2014-06-05 21:29:12
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lihuan2729

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
sxyhelen: 金币+2 2014-06-17 10:30:13
先做序列比对看哈重组什么的，推荐mauve或者muscle
再构建进化树，有几种方法：maximum pasimony; maximum likelyhood, bayesian inference. 针对这三种方法你可以选合适的软件。
http://www.plob.org/2013/02/27/5547.html
可以看看这个
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4楼2014-06-12 16:06:03
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 应助指数-1, 屏蔽内容, 禁止宣传小木虫以外的网站 2014-06-06 19:19:27
本帖内容被屏蔽
2楼2014-06-06 13:36:45
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growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
sxyhelen: 金币+1, 多谢回帖 2014-06-11 09:48:00
首先进行序列比对，推荐muscle
然后构建进化树，推荐MEGA
赞一下 回复此楼
3楼2014-06-08 22:14:55
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