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hailey

银虫 (小有名气)

[求助] 2.3kb 大片段pcr 求赐教 已有4人参与

请路过的虫友大神们看看,我的片段是2.3kb的,GC 含量是59.61%  ,所以就没用GC buffer 。
所用PCR体系25ul  ,
10*transtart buffer 2.5ul
transtart Taq  ase    0.5ul
dNTPs  1ul
primer1  1ul
primer    1ul
cDNA   2ul
dd 水  17ul  

95度 5min
94度 30s
51度 -61度  设置梯度 各30s
72度 2.5min
72度 10min
35个循环

没有P出来目的条带,什么都没有,本想上传图片的,网络不好没有上传成功

求赐教
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时刻为梦想而战!!
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王小七wq

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
13楼: Originally posted by hailey at 2014-06-03 19:19:08
嗯嗯。。。好,我计划试试,同学能说的详细点吗,急求!...

不好意思,我看错了,但愿你没按我说的90s做,要不我就罪过大了。应该是30s,我之前用taq酶pcr时,(ddw32ul;5xHF buffer 10ul;dntp 2ul;primer mix 2ul;模版5ul)
98度,2min;
98度30s;
退火温度55度,30s;
72度,1min;
72度,5min.
18个循环

也用过Q5,体系50ul,(ddw35ul;q5反应液10ul;dntp1ul;primer mix2ul;模版1.5ul;q5酶0.5ul);
预变性98度30s;
变形98度15s;
复性55度20s;
延伸72度150s;
再延伸72度5min.
20个循环
19楼2014-06-06 17:37:43
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BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-02 10:49:45
换cDNA模板。
2.3k不大,cDNA模板质粒不高通常是P不出来的原因。另外,cDNA是有组织特异性的,你的基因确定在这个组织或细胞系中有比较高的表达?
2楼2014-06-02 07:34:15
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hailey

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by BioChen at 2014-06-02 07:34:15
换cDNA模板。
2.3k不大,cDNA模板质粒不高通常是P不出来的原因。另外,cDNA是有组织特异性的,你的基因确定在这个组织或细胞系中有比较高的表达?

嗯嗯。。。是有高表达的,可以查到相关文献的,今天准备加10* GC  enhanger 试试..
时刻为梦想而战!!
3楼2014-06-02 09:12:30
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BioChen

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hailey at 2014-06-02 09:12:30
嗯嗯。。。是有高表达的,可以查到相关文献的,今天准备加10* GC  enhanger 试试.....

之前的回答,打错字了,囧
是cDNA质量不高
4楼2014-06-02 09:19:40
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