| 查看: 3626 | 回复: 11 | |||
吉米爱多铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
Material studio dynamics模拟后分子跑出盒子！ 已有1人参与
|
| 建立了3*3*3的晶胞以及一个水层，叠加后进行了200p的dynamics模拟，但是模拟后体系中部分分子跑出了盒子外。在display style--lattice中，有几个选项，分别是default/in-cell/original/none，选择了in-cell之后则盒子外的分子都不显示了，并且盒子内多出了一些分子（猜测是其他单元跑进来的？）。求问，选择in-cell进行分析是不是和default等价？或者能不能在动力学模拟的时候限制分子不跑出盒子外？ |
回复此楼» 猜你喜欢
今天务委会开完了，明天出结果吗
已经有13人回复
-
放榜前的不淡定
已经有19人回复
-
某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感
已经有10人回复
-
有没有大神帮我看看基金代码
已经有9人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有23人回复
-
在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。
已经有8人回复
-
今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果
已经有22人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有8人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子
已经有19人回复
- 求助：Gromacs平衡时蛋白跑出盒子了，怎么办？
已经有7人回复
- 体系中有很多水分子，如何用rattle命令限制水分子的类型和键长键角
已经有14人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- 请教做MD计算时，蛋白质分子有一部分跑出水盒子
已经有9人回复
- 【讨论】系综问题
已经有32人回复
月只蓝
主管区长 (职业作家)
-
专家经验: +1059 - 模拟EPI: 1
- 应助: 1712 (讲师)
- 贵宾: 8.888
- 金币: 68171.7
- 散金: 1938
- 红花: 443
- 沙发: 4
- 帖子: 4373
- 在线: 3292.4小时
- 虫号: 1122189
- 注册: 2010-10-14
- 专业: 宇宙学
- 管辖: 计算模拟区
2楼2014-05-31 18:12:08
吉米爱多
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6158.1
- 散金: 457
- 红花: 12
- 帖子: 1684
- 在线: 345.6小时
- 虫号: 2318682
- 注册: 2013-03-04
- 专业: 能源化工
3楼2014-05-31 19:10:35
月只蓝
主管区长 (职业作家)
-
专家经验: +1059 - 模拟EPI: 1
- 应助: 1712 (讲师)
- 贵宾: 8.888
- 金币: 68171.7
- 散金: 1938
- 红花: 443
- 沙发: 4
- 帖子: 4373
- 在线: 3292.4小时
- 虫号: 1122189
- 注册: 2010-10-14
- 专业: 宇宙学
- 管辖: 计算模拟区
4楼2014-05-31 20:27:08
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10372
- 散金: 3286
- 红花: 167
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
5楼2014-06-01 08:35:13
吉米爱多
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6158.1
- 散金: 457
- 红花: 12
- 帖子: 1684
- 在线: 345.6小时
- 虫号: 2318682
- 注册: 2013-03-04
- 专业: 能源化工
6楼2014-06-01 09:06:46
吉米爱多
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6158.1
- 散金: 457
- 红花: 12
- 帖子: 1684
- 在线: 345.6小时
- 虫号: 2318682
- 注册: 2013-03-04
- 专业: 能源化工
7楼2014-06-01 09:07:13
8楼2019-11-20 14:31:58
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2020-01-02 09:46:55
|
本帖内容被屏蔽 |
10楼2020-01-03 11:14:25
20
