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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 运行autogrid时出现错误
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JKcarrot

木虫 (小有名气)

[求助] 运行autogrid时出现错误 已有1人参与

在运行到autogrid时，出现了错误：can’t open or find receptor pdbqt 文件 是不是说我在准备受体柔性残基时出现了问题 我就是想知道具体怎么解决
希望高人支招 先谢过了
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1楼 2014-05-31 09:54:03
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JKcarrot

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-06-04 13:52:53
我是在linux下进行的对接，你找找论坛里资源吧，应该会帮你解决问题。我没在win下操作过...

谢谢
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5楼2014-06-04 14:34:33
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13581286695

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不是在准备受体柔性残基时出现错误，而是系统找不到受体的坐标形式（pdbqt）。你重新准备一下受体蛋白，记得保存为pdbqt试一下，应该就可以了
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天道酬勤
2楼2014-06-03 14:52:59
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JKcarrot

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-06-03 14:52:59
不是在准备受体柔性残基时出现错误，而是系统找不到受体的坐标形式（pdbqt）。你重新准备一下受体蛋白，记得保存为pdbqt试一下，应该就可以了

恩恩 我试了很多次 我觉得我保存没有问题 如果说是路径问题 我又不知道问题出在哪里 请问你也是在win下进行的分子对接吗
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3楼2014-06-04 10:50:03
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13581286695

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by JKcarrot at 2014-06-04 10:50:03
恩恩 我试了很多次 我觉得我保存没有问题 如果说是路径问题 我又不知道问题出在哪里 请问你也是在win下进行的分子对接吗...

我是在linux下进行的对接，你找找论坛里资源吧，应该会帮你解决问题。我没在win下操作过
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天道酬勤
4楼2014-06-04 13:52:53
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