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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » 【求助】求助：安装abinit-6.2.3出现错误
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miaozhang

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助：安装abinit-6.2.3出现错误 已有2人参与

第一次接触abinit，以前也没接触过，弱弱问下面这个问题是怎么回事？
/usr/bin/install -c abinetcdf abinit aim anaddb band2eps conducti cut3d fftprof lwf mrgddb mrggkk mrgscr newsp optic ujdet macroave '/usr/local/bin'
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/abinetcdf': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/abinit': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/aim': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/anaddb': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/band2eps': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/conducti': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/cut3d': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/fftprof': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/lwf': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/mrgddb': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/mrggkk': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/mrgscr': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/newsp': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/optic': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/ujdet': Permission denied
/usr/bin/install: cannot create regular file `/usr/local/bin/macroave': Permission denied
make[3]: *** [install-binPROGRAMS] Error 1
make[3]: Leaving directory `/home/ygzhang/abinit-6.2.3/src/98_main'
make[2]: *** [install-am] Error 2
make[2]: Leaving directory `/home/ygzhang/abinit-6.2.3/src/98_main'
make[1]: *** [install-recursive] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/ygzhang/abinit-6.2.3/src'
make: *** [install-recursive] Error 1
见有人出现过相同问题，但没看懂到底是什么原因，怎么解决啊？
还有在并行机上安装abinit需要设置什么东西吗？
谢谢！！！
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1楼 2010-09-30 13:46:16
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
miaozhang(金币+2): 2010-10-01 08:51:19
zzy870720z(金币+2):侯老师辛苦了，多谢指点 2010-10-01 21:22:01
问题出在，你在configure这一步时，没有指定安装的目录(也就是没有设置--prefix的赋值)，那运行make install这一步的时候，就默认得编译得到的abinit可执行模块都要拷贝到/usr/local/bin目录下，但是，这个目录一般是只有root权限的用户可以才可读写文件。

解决的办法：重新./configure ---prefix="指定一个你当前用户帐号可以读写的目录"  .........
其他的与你以前的设置和做的步骤一样。再重新编译，安装。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-10-01 08:19:11
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wenjlu

木虫 (正式写手)
★ ★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
miaozhang(金币+1): 2010-10-01 08:51:30
zzy870720z(金币+1):谢谢提示，一般软件还是不用root安装为好 2010-10-01 21:22:36
Permission denied

要切换 root 用户组
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-01 08:36:07
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miaozhang

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-10-01 08:19:11:
问题出在，你在configure这一步时，没有指定安装的目录(也就是没有设置--prefix的赋值)，那运行make install这一步的时候，就默认得编译得到的abinit可执行模块都要拷贝到/usr/local/bin目录下，但是，这个目录一 ...

在并行机上这样就可以了吗？需要设置一些参数吗？
谢谢！
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4楼2010-10-01 08:54:04
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太阳谷
★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
5楼2010-10-01 09:02:22
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miaozhang

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wenjlu at 2010-10-01 08:36:07:
Permission denied

要切换 root 用户组

老师把root收回去了，我只在自己的帐号下安装，应该可以用吧？
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6楼2010-10-01 09:03:42
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-10-01 21:22:56
安装到你自己的目录中，也是可以用。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-10-01 14:35:11
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zhouhua0227

新虫 (小有名气)

abinit

★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
楼主啊，你有abinit软件包，能不能上传啊？我找了好久，都没有找到！先谢谢了！
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-10-01 16:41:10
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
miaozhang(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):辛苦了 2010-10-01 21:23:09
引用回帖:
Originally posted by zhouhua0227 at 2010-10-01 16:41:10:
楼主啊，你有abinit软件包，能不能上传啊？我找了好久，都没有找到！先谢谢了！

http://www.abinit.org
官方网站
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储氢家族欢迎储氢研究者！
9楼2010-10-01 20:23:32
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miaozhang

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-10-01 14:35:11:
安装到你自己的目录中，也是可以用。

IFORT，  MPI，我都装上了，在.BASHRC中指认了路径：
# .bashrc
# User specific aliases and functions
export PATH=/home/ygzhang/mpich2/bin:$PATH
export PATH=/home/ygzhang/abinit/bin:$PATH
# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

然后./configure --prefix=/home/abinit FC=mpif90   --enable-mpi=yes
出现了以下错误，
checking for mpif90... /opt/intel/impi/3.1/bin64/mpif90
checking whether we are using the GNU Fortran compiler... no
checking whether mpif90 accepts -g... no
checking which type of Fortran compiler we have... generic 0.0
checking fortran 90 modules extension...
configure: setting Fortran module extension to ".mod"
checking for Fortran flag to compile .F90 files... unknown
configure: WARNING: Fortran file extension could not be changed
configure: WARNING: some advanced Fortran tests may fail
configure: determining Fortran module case
configure: error: in `/home/ygzhang/abinit-6.2.3':
configure: error: unable to compile a simple Fortran module
不知怎么解决，是f90的编译器出问题了？
谢谢！
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10楼2010-10-02 09:01:30
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