24小时热门版块排行榜    

查看: 1183  |  回复: 4

JKcarrot

木虫 (小有名气)

[求助] 运行autogrid时出现错误 已有1人参与

在运行到autogrid时,出现了错误:can’t open or find receptor pdbqt 文件 是不是说我在准备受体柔性残基时出现了问题 我就是想知道具体怎么解决
希望高人支招 先谢过了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13581286695

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不是在准备受体柔性残基时出现错误,而是系统找不到受体的坐标形式(pdbqt)。你重新准备一下受体蛋白,记得保存为pdbqt试一下,应该就可以了
天道酬勤
2楼2014-06-03 14:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JKcarrot

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-06-03 14:52:59
不是在准备受体柔性残基时出现错误,而是系统找不到受体的坐标形式(pdbqt)。你重新准备一下受体蛋白,记得保存为pdbqt试一下,应该就可以了

恩恩 我试了很多次 我觉得我保存没有问题 如果说是路径问题 我又不知道问题出在哪里 请问你也是在win下进行的分子对接吗
3楼2014-06-04 10:50:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13581286695

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by JKcarrot at 2014-06-04 10:50:03
恩恩 我试了很多次 我觉得我保存没有问题 如果说是路径问题 我又不知道问题出在哪里 请问你也是在win下进行的分子对接吗...

我是在linux下进行的对接,你找找论坛里资源吧,应该会帮你解决问题。我没在win下操作过
天道酬勤
4楼2014-06-04 13:52:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JKcarrot

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-06-04 13:52:53
我是在linux下进行的对接,你找找论坛里资源吧,应该会帮你解决问题。我没在win下操作过...

谢谢
5楼2014-06-04 14:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 JKcarrot 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +21 医学老男孩 2026-08-13 46/2300 2026-08-14 16:44 by ttzzttzz01
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +5 启萌科技 2026-08-12 16/800 2026-08-14 16:02 by 启萌科技
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
信息提示
请填处理意见