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汕头大学海洋科学接受调剂
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

[求助] 差分电荷密度图的疑惑 已有6人参与

大家好:
     我是新手,刚学着做差分电荷密度,作出来的图如下所示:
    我做的是掺杂体系,要看掺杂前后的电荷密度变化,我是分别计算出三个CHGCAR后直接在VESTA中相减的到的图片,不知道这个怎么分析啊?只知道红色区域表示电荷密度增大,蓝色减少,形成的键就不知道了,没学过量字化学啊,求高手帮忙下;
    第二个问题就大了,同样的三个CHGCCAR文件,在linix系统中用脚本CHGdiff.pl来依次相减,就是ABC-A,得到一个结果,再用它-C=chgdiff,放在vesta中显示,才好玩,和直接在vesta里相减得出的图完全不一样,如第二张图,这是怎么回事?
    我的体系是在SnO2中用Pd原子取代Sn原子形成的。

差分电荷密度图的疑惑
CHGCAR_vesta.jpg


差分电荷密度图的疑惑-1
CHGCAR.jpg
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zhangxinfr

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
paopaotu326: 金币+5, 有帮助, 麻烦您继续给我解答啊,谢谢啦:) 2014-05-26 11:02:14
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-06-10 09:10:43
没有理你是因为你提的问题太模糊了,你都不说那个图是哪个位置哪个原子的,也不具体说图是哪三个CHGCAR减出来的,ABC各代表啥,怎么给你分析
8楼2014-05-26 09:29:24
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

补充下第一张图的标尺,最上面是:0.1,最下面是-0。25
2楼2014-05-23 08:56:54
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

第三个疑惑,如果想把所获得的CHGCAR文件放在lev00里面处理,最后放在origin中作图,有个很大的问题,就是用lev00程序的时候,一开始就需要输入:outcar文件和contcar文件,之后才输入chgcar文件,那么最后输入的chgcar文件就用三个CHGCAR相减得到的差,可是前面地 outcar 和contcar该输入哪个?是ABC的,还是B的,或者C的? 我的理解是计算的时候三个东东的空间格子都建立的是一样的,NGX、NGY和NGZ也一样,那么是不是输入ABC的outcar和contcar就行了?
3楼2014-05-23 09:01:55
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

求帮忙啦,不然难毕业啦,吼吼              
4楼2014-05-23 09:02:46
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