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sweet561

银虫 (小有名气)

[求助] pPIC9表达质粒XhoI/EcoRI双酶切 已有2人参与

请问一下,我现在做pPIC9表达质粒构建,连上200bp目的片段,并做了PCR和测序鉴定,都是正确的。但现在用XhoI和EcoRI双酶切,除了切出pPIC9、200bp的目的条带外,在1000-2000bp处还有一条弱弱的条带,不知道是怎么回事,我已经检查了质粒里都分别只有一个XhoI和EcoRI的酶切位点,那这个表达质粒算是构建成功了吗,直接线性化做表达的话会有什么影响吗?请各位高手指点。谢谢!
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sweet561

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-21 14:36:14
pPIC9K的BamHI位点在α-signal sequence前面,整个质粒上还有几个和酶识别位点差一个碱基的位点,如果酶切条件不合适都可能切出来,如果酶切不完全质粒的超螺旋没去除干净也会出现条带,只要你用通用引物测序正确就 ...

哦,因为我的目的基因先是连在pPIC9上,然后再用BamHI和EcoRI将目的片段从pPIC9上切下,再连到pPIC9K上的,所以pPIC9K上切掉的信号肽,会跟目的基因连接后补上。
8楼2014-05-21 16:37:36
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rv1nm2y

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不放心的话测序看看。
2楼2014-05-19 16:20:10
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是酶切酶连构建的重组质粒还是反向PCR构建的?你测序是用的通用引物还是自己的引物?如果是酶切酶连,测序用的通用引物那就没啥问题,杂带是酶切条件不好导致的非特异切割,不影响你的线性化。
还有pPIC9和你的基因大小差别太大,做双酶切验证效果很差,既然有PCR和测序验证,就不需要做酶切验证了。
大家相互帮助哈
3楼2014-05-19 20:19:27
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sweet561

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-19 20:19:27
是酶切酶连构建的重组质粒还是反向PCR构建的?你测序是用的通用引物还是自己的引物?如果是酶切酶连,测序用的通用引物那就没啥问题,杂带是酶切条件不好导致的非特异切割,不影响你的线性化。
还有pPIC9和你的基因 ...

谢谢!只是我还要换酶切位点,再将目的基因转到pPIC9K里,之后pPIC9K-目的基因,也是用PCR、测序验证没问题,就是双酶切有另外一条非特异条带,是酶切酶连,而且是通用引物,就是害怕之后直接线性化会有问题。
4楼2014-05-20 16:49:25
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