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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 全原子模型转换成粗粒化模型

本人菜鸟,请问如何实现将全原子模型转换成粗粒化模型,除了VMD还有哪些软件可以实现呢?
最好是比较好上手的,本人正在学习阶段,有教程的最好
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wjl1314

银虫 (小有名气)

采用lammps 里面的moltemplate 模块
2楼2014-09-05 15:16:21
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615633

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wjl1314 at 2014-09-05 15:16:21
采用lammps 里面的moltemplate 模块

你好,请问一下怎么采用?最近在搞粗粒化,但总搞不出来
3楼2014-09-20 19:01:07
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615633

铁虫 (初入文坛)

你好 请问用vmd怎么实现啊?
4楼2014-09-20 19:02:21
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 615633 at 2014-09-20 19:01:07
你好,请问一下怎么采用?最近在搞粗粒化,但总搞不出来...

你好,我也没有弄出来
5楼2014-09-22 08:47:16
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 615633 at 2014-09-20 19:02:21
你好 请问用vmd怎么实现啊?

我也没有弄出来,不过VMD主要针对蛋白质、DNA等生命领域的分子,别的分子容易出现问题
6楼2014-09-22 08:48:28
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青青白白123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-09-22 08:48:28
我也没有弄出来,不过VMD主要针对蛋白质、DNA等生命领域的分子,别的分子容易出现问题...

您好,请问你后来怎么做的粗粒化啊,跪求指教。。
7楼2019-03-15 11:07:24
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