版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(3279)
>
虫友互识
(304)
>
休闲灌水
(268)
>
文献求助
(259)
>
导师招生
(189)
>
考博
(76)
>
硕博家园
(71)
>
招聘信息布告栏
(62)
>
论文投稿
(58)
>
博后之家
(44)
>
考研
(42)
>
教师之家
(39)
>
公派出国
(30)
>
基金申请
(28)
>
外文书籍求助
(21)
>
绿色求助(高悬赏)
(18)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
其他
»
全原子模型转换成粗粒化模型
7
1/1
返回列表
查看: 1909 | 回复: 6
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
赵红霞
铁杆木虫
(著名写手)
应助: 73
(初中生)
金币: 6211.9
散金: 141
红花: 33
帖子: 1540
在线: 699.5小时
虫号: 1544094
注册: 2011-12-20
性别:
MM
专业: 理论和计算化学
[
求助
]
全原子模型转换成粗粒化模型
本人菜鸟,请问如何实现将全原子模型转换成粗粒化模型,除了VMD还有哪些软件可以实现呢?
最好是比较好上手的,本人正在学习阶段,有教程的最好
回复此楼
» 猜你喜欢
假如你的研究生提出不合理要求
已经有8人回复
萌生出自己或许不适合搞科研的想法,现在跑or等等看?
已经有4人回复
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
参与限项
已经有3人回复
实验室接单子
已经有4人回复
全日制(定向)博士
已经有4人回复
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
求助:我三月中下旬出站,青基依托单位怎么办?
已经有12人回复
所感
已经有4人回复
要不要辞职读博?
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
原子力显微镜里面的DMT模型和JKR模型的区别和适用之处
已经有31人回复
我想用欧拉模型模拟流化床内物料的干燥,怎样给颗粒相加上湿度不是很清楚
已经有23人回复
Slab模型原子层数确定
已经有15人回复
请问gromacs导入EAM势能函数的问题和lammps导入martini粗粒化力场的问题
已经有4人回复
一个关于限制性剪切模型应力提取的问题!!!
已经有8人回复
求质心,粗粒化后的参数获取
已经有10人回复
Gromacs粗粒化力场(自己写)
已经有11人回复
凝固熔化模型计算凝壳形成过程
已经有9人回复
通过蛋白质骨架还原全原子坐标
已经有6人回复
如何在MS的模型中的晶胞一个棱上(只有一个原子)掺杂替代这个原子
已经有13人回复
material studio DPD模块 模拟结果的RDF分析
已经有18人回复
模型计算完后,如何调整掺杂原子在超胞中位置
已经有5人回复
模型中的原子怎么可以单独复制出来,作为示例原子以标注其名称
已经有7人回复
【求助】MS里建的模型只有原子,没有键啊
已经有9人回复
【求助】vasp为什么采用周期性边界条件(或超原胞模型)来处理原子分子表面体系等,有
已经有8人回复
【讨论】这种三维模型能简化成二维么?
已经有14人回复
【讨论】收缩未反应核模型和粒径不变的收缩未反应核模型
已经有4人回复
【求助】ms模型原子坐标的导出
已经有11人回复
1楼
2014-05-15 13:59:56
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
wjl1314
银虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1531.1
红花: 1
帖子: 86
在线: 208.5小时
虫号: 1447444
注册: 2011-10-17
专业: 有机分子功能材料化学
采用lammps 里面的moltemplate 模块
赞
一下
回复此楼
2楼
2014-09-05 15:16:21
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
615633
铁虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 190.5
帖子: 22
在线: 33.9小时
虫号: 1817149
注册: 2012-05-14
专业: 金属非晶态、准晶和纳米晶
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
wjl1314
at 2014-09-05 15:16:21
采用lammps 里面的moltemplate 模块
你好,请问一下怎么采用?最近在搞粗粒化,但总搞不出来
赞
一下
回复此楼
3楼
2014-09-20 19:01:07
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
615633
铁虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 190.5
帖子: 22
在线: 33.9小时
虫号: 1817149
注册: 2012-05-14
专业: 金属非晶态、准晶和纳米晶
你好 请问用vmd怎么实现啊?
赞
一下
回复此楼
4楼
2014-09-20 19:02:21
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
赵红霞
铁杆木虫
(著名写手)
应助: 73
(初中生)
金币: 6211.9
散金: 141
红花: 33
帖子: 1540
在线: 699.5小时
虫号: 1544094
注册: 2011-12-20
性别:
MM
专业: 理论和计算化学
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
615633
at 2014-09-20 19:01:07
你好,请问一下怎么采用?最近在搞粗粒化,但总搞不出来...
你好,我也没有弄出来
赞
一下
回复此楼
5楼
2014-09-22 08:47:16
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
赵红霞
铁杆木虫
(著名写手)
应助: 73
(初中生)
金币: 6211.9
散金: 141
红花: 33
帖子: 1540
在线: 699.5小时
虫号: 1544094
注册: 2011-12-20
性别:
MM
专业: 理论和计算化学
引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
615633
at 2014-09-20 19:02:21
你好 请问用vmd怎么实现啊?
我也没有弄出来,不过VMD主要针对蛋白质、DNA等生命领域的分子,别的分子容易出现问题
赞
一下
回复此楼
6楼
2014-09-22 08:48:28
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
青青白白123
新虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 174.6
帖子: 123
在线: 28.3小时
虫号: 7408360
注册: 2017-11-01
专业: 工程热物理相关交叉领域
引用回帖:
6楼
:
Originally posted by
赵红霞
at 2014-09-22 08:48:28
我也没有弄出来,不过VMD主要针对蛋白质、DNA等生命领域的分子,别的分子容易出现问题...
您好,请问你后来怎么做的粗粒化啊,跪求指教。。
赞
一下
回复此楼
7楼
2019-03-15 11:07:24
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
我要订阅楼主
Andsharia
的主题更新
7
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定