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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请教启动子序列预测方法
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

[求助] 请教启动子序列预测方法 已有4人参与

现已扩增一基因的基因组前端序列，求助各位大神如何预测此序列的启动子，以及转录起始位点和转录因子结合位点？不甚感激！！！
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植根于内心的修养；无需提醒的自觉；以约束为前提的自由；为别人着想的善良
1楼 2014-04-29 19:25:13
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 曼舞流苏 at 2014-05-05 09:57:28
师兄师姐也不很清楚到底怎么弄，他们只是在NCBI里面查找一些引物特异性什么的。但是我在浏览网页的时候看到了这个，你看看对你是不是有用。。

【你这个是经典的启动子mapping实验
很简单，你可以搞一个报告基因 ...

感谢您的帮忙，现在已让公司继续测序，至于启动子后续的验证实验我会参考分子克隆实验指南及相关文献吧，不过这得等老师安排才行，现在要等测序结果
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植根于内心的修养；无需提醒的自觉；以约束为前提的自由；为别人着想的善良
14楼2014-05-05 11:05:59
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biology-boy

禁虫 (正式写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-04-29 21:11:15
本帖内容被屏蔽
2楼2014-04-29 19:51:53
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
什么物种呢？
如果是大肠杆菌的话，你可以看看ecocyc和regulonDB
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3楼2014-04-30 05:41:07
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng_xu at 2014-04-30 05:41:07
什么物种呢？
如果是大肠杆菌的话，你可以看看ecocyc和regulonDB

真核的
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植根于内心的修养；无需提醒的自觉；以约束为前提的自由；为别人着想的善良
4楼2014-04-30 09:23:00
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