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西门吹雪170荣誉版主 (职业作家)
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[求助]
请教启动子序列预测方法已有4人参与
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| 现已扩增一基因的基因组前端序列,求助各位大神如何预测此序列的启动子,以及转录起始位点和转录因子结合位点?不甚感激!!! |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+5, ★有帮助, 感谢热心帮忙 2014-05-05 11:03:09
西门吹雪170: 金币+5, ★有帮助, 感谢热心帮忙 2014-05-05 11:03:09
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师兄师姐也不很清楚到底怎么弄,他们只是在NCBI里面查找一些引物特异性什么的。但是我在浏览网页的时候看到了这个,你看看对你是不是有用。。 【你这个是经典的启动子mapping实验 很简单,你可以搞一个报告基因系统,Luciferase、CAT、甚至来个GFP也行。 然后找一个没有启动子的表达载体,Luciferase系统的就是pGL3-Basic应该 再把你怀疑有启动子活性的片段装进去 检测下游报告基因是否表达 用这个系统,你可以通过不断的做deletion,找到你这段长序列里面的核心启动子 看看《分子克隆》第三版,有这些内容很详细的说明】 希望对你有用吧。。。 |
12楼2014-05-05 09:57:28
biology-boy
禁虫 (正式写手)
★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-04-29 21:11:15
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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-04-29 21:11:15
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2楼2014-04-29 19:51:53
3楼2014-04-30 05:41:07
西门吹雪170
荣誉版主 (职业作家)
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4楼2014-04-30 09:23:00













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