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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 在算过渡态时，遇到的问题
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画心

金虫 (小有名气)

[求助] 在算过渡态时，遇到的问题 已有2人参与

如图，请问一下，图中画圈的部分是怎么来的，文章是这么说的Fig. 3. Energy profile of the dissociation processes of AsH3 (a) and H2Se (b) on the Pd(111) surface. The symbol ‘+’ represents the adsorbates in the same unit cell, while the ‘|’symbol represents the adsorbates in the separate unit cells.怎么把AsH2和H原子放在分开的晶胞中算？顺便把文章也传上在算过渡态时，遇到的问题
1.jpg
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  • 附件 1 : AsH3_H2Se_S_Pd(111).pdf
    • 2014-04-27 21:16:07, 1.69 M

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1楼 2014-04-27 21:16:16
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画心

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 10:13:09
仔细看了文献，前面我的理解有问题。应该还是在同一个晶胞。只是吸附物初始位置的不同。
开始的时候是fig4 中AsH2中的第一个图，也就是初始态，你说的第二数据，应该第三个图的能量。

我还是有些疑问，图中的-0.88不是对应的是AsH3的第三个图吗？（也就是解离后的构型）如果-0.84对应的是AsH2的第一个图（第二步解离的起始态），那它们之间的能量差应该不止0.04eV,H原子的能量就有13.56ev
附上一张图，图中的2与3之间的能量差是不是也是前面说的那个相互作用力
在算过渡态时，遇到的问题-1
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5楼2014-04-28 16:10:10
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
画心: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-04-28 17:33:34
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:28:55
从上面的文章来看，楼主的理解上可能有些问题。
The symbol ‘+’ represents the adsorbates in the same unit cell, while the ‘|’symbol represents the adsorbates in the separate unit cells.
“+”表示放在相同的晶胞
“|”表示不同的晶胞，而不是楼主理解的分开的晶胞。
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2楼2014-04-27 23:39:39
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画心

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 23:39:39
从上面的文章来看，楼主的理解上可能有些问题。
The symbol ‘+’ represents the adsorbates in the same unit cell, while the ‘|’symbol represents the adsorbates in the separate unit cells.
“+”表示放 ...

谢谢你的解答，但还请问一下，难道是把H放在Pd的一个晶胞中，AsH2放在另一个晶胞中，那怎么得到文章说的他们的相互作用能呢（也就是图中圈里的那个能力差）？
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3楼2014-04-28 09:17:46
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-05-04 07:49:29
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 22:29:12
仔细看了文献，前面我的理解有问题。应该还是在同一个晶胞。只是吸附物初始位置的不同。
开始的时候是fig4 中AsH2中的第一个图，也就是初始态，你说的第二数据，应该第三个图的能量。
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画心
4楼2014-04-28 10:13:09
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