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森林中的风

铁虫 (小有名气)

[求助] 现在各种蛋白组学的方法中,那种方法找差异蛋白最有效. 已有2人参与

RT.
二维电泳(2D-PAGE),荧光差异荧光凝胶电泳技术(DIGE),同位素标记定量技术(iTRAQ),SELDI蛋白芯片,蛋白质非标记标记技术(Label free).等方法那种出的结果重复性较高,最可信.
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Rubisco580

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
森林中的风: 金币+5 2014-05-07 16:42:51
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-09 10:38:35
后几种都比较靠谱。
DIGE个人认为不划算,定量不精确,还非常昂贵。
2D和DIGE无论通量、灵敏度都不如后面几个。
2楼2014-04-25 15:35:49
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wabash2011

铜虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-09 10:38:40
应该说各有优缺点。“DIGE个人认为不划算,定量不精确,还非常昂贵。“????
DIGE定量相对准确,也不昂贵。一块DIGE胶,包括胶条、荧光染料、SDS-PAGE胶,成本不过200元左右。3个生物学重复实验,可以迅速判断不同样品及处理的重复性问题,这是质谱为主的分析不能比拟的。贵的是2-DE点的质谱分析。
最好是结合不同方法。
3楼2014-05-08 08:39:11
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Rubisco580

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-09 10:38:45
内容已删除
4楼2014-05-08 14:22:43
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wabash2011

铜虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-09 10:38:51
DIGE成本:IPG胶条120元,dye(非GE,从另一公司)一块胶只需12元,SDS-PAGE胶15元,加起来小于150元每个胶。三块胶(如比较突变体与与对照),可以看出生物学样品之间的重复性,然后可以挑点送质谱测序(一个点200元以上)。剩下的蛋白样品也可送iTRAQ分析(3个比较共6个样品需要5万元)。
DIGE系统需要200万仪器投资,质谱系统需要500万仪器投资。这个都需要平台支持。我们有DIGE系统,也在筹建质谱平台。我们帮其他团队进行DIGE分析时,不收费。
5楼2014-05-08 20:18:32
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Rubisco580

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wabash2011 at 2014-05-08 20:18:32
DIGE成本:IPG胶条120元,dye(非GE,从另一公司)一块胶只需12元,SDS-PAGE胶15元,加起来小于150元每个胶。三块胶(如比较突变体与与对照),可以看出生物学样品之间的重复性,然后可以挑点送质谱测序(一个点200 ...

荧光染料这么便宜!!!
是Cy2、3、5吗?
6楼2014-05-09 16:22:44
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wabash2011

铜虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

荧光染料这么便宜!!!
是Cy2、3、5吗?


是的,加起来一次不过10余元。
7楼2014-05-10 09:36:21
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zp519

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wabash2011 at 2014-05-08 20:18:32
DIGE成本:IPG胶条120元,dye(非GE,从另一公司)一块胶只需12元,SDS-PAGE胶15元,加起来小于150元每个胶。三块胶(如比较突变体与与对照),可以看出生物学样品之间的重复性,然后可以挑点送质谱测序(一个点200 ...

请问 iTRAQ和非标记 相比优缺点各怎么样,需要多少钱啊,谢谢
8楼2014-10-27 10:52:17
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