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lammps-vmd可视化问题
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lammps-vmd可视化问题
请问一下我把lammps的xyz文件导入到vmd中,但是由于周期性导致最上面的原子和最下面的原子连接起来,看起来很混乱,请问怎么解决。
N[O3D$16SC10D53FJWNP5F6.jpg
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1楼
2014-04-23 21:02:08
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4楼
:
Originally posted by
老菜子
at 2014-04-24 09:25:03
用 unwrap
请问楼主,能说具体一点吗?我也遇到这个问题,不知道怎么弄呢?
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6楼
2014-09-01 08:47:33
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5楼
:
Originally posted by
jfyh2008
at 2014-05-12 11:02:35
请问你用的unwrap是另外一个软件吗?还是在VMD中的插件呀,可以具体阐述一下吗?我也有这个问题,谢谢...
请问你的问题解决了吗?我也遇到你的问题不知道怎么办呢,能否赐教?
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7楼
2014-09-01 08:48:10
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4楼
:
Originally posted by
老菜子
at 2014-04-24 09:25:03
用 unwrap
请问楼主是用 dump dcd 和 dump_modify unwrap 命令来实现吗?
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8楼
2014-09-01 09:45:37
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9楼
:
Originally posted by
jiangtao9571
at 2014-09-01 10:05:30
其实有更好的办法,我从一开始到现在用了5年半,写一个tcl读取键文件即可得到最真实的化学键。不过粗略看一下结果的话可以先限制坐标即可。...
您说的tcl是一段程序吗?
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10楼
2014-09-01 10:24:12
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