24小时热门版块排行榜    

查看: 3071  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

老菜子

铁虫 (初入文坛)

[求助] lammps-vmd可视化问题

请问一下我把lammps的xyz文件导入到vmd中,但是由于周期性导致最上面的原子和最下面的原子连接起来,看起来很混乱,请问怎么解决。

lammps-vmd可视化问题
N[O3D$16SC10D53FJWNP5F6.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

男儿志在四方岂能焉在闺房
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 老菜子 at 2014-04-24 09:25:03
用 unwrap

请问楼主,能说具体一点吗?我也遇到这个问题,不知道怎么弄呢?
6楼2014-09-01 08:47:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jfyh2008 at 2014-05-12 11:02:35
请问你用的unwrap是另外一个软件吗?还是在VMD中的插件呀,可以具体阐述一下吗?我也有这个问题,谢谢...

请问你的问题解决了吗?我也遇到你的问题不知道怎么办呢,能否赐教?
7楼2014-09-01 08:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 老菜子 at 2014-04-24 09:25:03
用 unwrap

请问楼主是用 dump dcd 和 dump_modify  unwrap 命令来实现吗?
8楼2014-09-01 09:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by jiangtao9571 at 2014-09-01 10:05:30
其实有更好的办法,我从一开始到现在用了5年半,写一个tcl读取键文件即可得到最真实的化学键。不过粗略看一下结果的话可以先限制坐标即可。...

您说的tcl是一段程序吗?
10楼2014-09-01 10:24:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 老菜子 的主题更新
信息提示
请填处理意见