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zal7891

木虫 (小有名气)

[求助] ELK简单计算失败,求高手解答! 已有1人参与

初学ELK软件,测试了一些金属化合物体系,计算还都可以进行。但是最近计算了一下铂系金属氮化物PtN2,发现连简单的自洽都不能进行。化合物的特点是结构中包含N-N这样距离较短的二聚物氮单元,Muffin-tin半径可能对计算有一定影响,所以测试了一下“rgkmax”参数,从7.0到12.0,但是计算仍然不能完成。计算过程中警告很多,如:
Warning(linengy): could not find linearisation energies in s.c. loop
Warning(occupy): minimum eigenvalue less than minimum linearisation energy
Warning(rhonorm): total charge density incorrect for s.c. loop  
Warning(occupy): could not find Fermi energy
Error(genlofr): degenerate local-orbital radial functions
在这里求助木虫上的朋友帮忙,大家是否有遇到过类似问题,尤其是对这样的包含N-N二聚物的体系是否有特别要注意的设置,这里先行谢过。
以下是我的ELK输入参数:
tasks
  0

xctype
  20 0 0

rgkmax
  12.0

ngridk
  3  3  3

scale
  1.0

sppath
  '/xxxxx/species/'

avec
  9.197145208       0.000000000       0.000000000
  0.000000000       9.197145208       0.000000000
  0.000000000       0.000000000       9.197145208

atoms
    2                                    : nspecies
'Pt.in'                                 : spfname
    4                                    : natoms; atposl, bfcmt below
    0.00000000    0.00000000    0.00000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.50000000    0.00000000    0.50000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.50000000    0.50000000    0.00000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.00000000    0.50000000    0.50000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
'N.in'                                  : spfname
    8                                    : natoms; atposl, bfcmt below
    0.41612397    0.41612397    0.41612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.58387603    0.58387603    0.58387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.08387603    0.58387603    0.91612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.91612397    0.41612397    0.08387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.91612397    0.08387603    0.58387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.08387603    0.91612397    0.41612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.58387603    0.91612397    0.08387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.41612397    0.08387603    0.91612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
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大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣

想算个二聚体的能量与距离变化曲线,求大佬带一下ELK的使用...
一步一步往上走,,,,
5楼2019-09-18 15:46:03
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zal7891: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 谢谢回复! 2014-04-29 19:58:46
看看这个,默认的N参数找不到线性化能量,我换成lapw基组了。
elk.in
CODE:
tasks
  0

stype
  0

swidth
  0.01

lradstp
  2

xctype
  20 0 0

trimvg
  .true.

gmaxvr
  14.0

nrmtscf
  4

autolinengy
  .true.

lmaxapw
  10

lmaxvr
  8

mixtype
  2

rgkmax
  8.0

ngridk
  3 3 3

scale
  1.0

avec
  9.197145208       0.000000000       0.000000000
  0.000000000       9.197145208       0.000000000
  0.000000000       0.000000000       9.197145208

atoms
    2                                    : nspecies
'Pt.in'                                 : spfname
    4                                    : natoms; atposl, bfcmt below
    0.00000000    0.00000000    0.00000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.50000000    0.00000000    0.50000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.50000000    0.50000000    0.00000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.00000000    0.50000000    0.50000000    0.00000000  0.00000000  0.00000000
'N.in'                                  : spfname
    8                                    : natoms; atposl, bfcmt below
    0.41612397    0.41612397    0.41612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.58387603    0.58387603    0.58387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.08387603    0.58387603    0.91612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.91612397    0.41612397    0.08387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.91612397    0.08387603    0.58387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.08387603    0.91612397    0.41612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.58387603    0.91612397    0.08387603    0.00000000  0.00000000  0.00000000
    0.41612397    0.08387603    0.91612397    0.00000000  0.00000000  0.00000000

Pt.in
CODE:
'Pt'                                       : spsymb
'platinum'                                 : spname
  -78.0000                                  : spzn
   355605.4398                              : spmass
  0.226455E-06    2.500   40.1191   700    : sprmin, rmt, sprmax, nrmt
  22                                        : spnst
   1   0   1   2.00000    T                 : spn, spl, spk, spocc, spcore
   2   0   1   2.00000    T
   2   1   1   2.00000    T
   2   1   2   4.00000    T
   3   0   1   2.00000    T
   3   1   1   2.00000    T
   3   1   2   4.00000    T
   3   2   2   4.00000    T
   3   2   3   6.00000    T
   4   0   1   2.00000    T
   4   1   1   2.00000    T
   4   1   2   4.00000    T
   4   2   2   4.00000    T
   4   2   3   6.00000    T
   4   3   3   6.00000    F
   4   3   4   8.00000    F
   5   0   1   2.00000    T
   5   1   1   2.00000    F
   5   1   2   4.00000    F
   5   2   2   4.00000    F
   5   2   3   5.00000    F
   6   0   1  1.000000    F
   1                                        : apword
    0.1500   0  F                           : apwe0, apwdm, apwve
   0                                        : nlx
   7                                        : nlorb
   0   2                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   1   2                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   2   2                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   3   2                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   3   3                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   -2.5235   0  T
   1   3                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   -1.9151   0  T
   2   3                                    : lorbl, lorbord
    0.1500   0  F                           : lorbe0, lorbdm, lorbve
    0.1500   1  F
   -0.2143   0  T

N.in
CODE:
'N'                                        : spsymb
'nitrogen'                                 : spname
  -7.00000                                  : spzn
   25532.65214                              : spmass
  0.755929E-06    1.3000   34.9411   300    : sprmin, rmt, sprmax, nrmt
   4                                        : spnst
   1   0   1   2.00000    T                 : spn, spl, spk, spocc, spcore
   2   0   1   2.00000    F
   2   1   1  1.000000    F
   2   1   2   2.00000    F
   2                                        : apword
    0.1500   0  F                           : apwe0, apwdm, apwve
    0.1500   1  F                           : apwe0, apwdm, apwve
   0                                        : nlx
   0                                        : nlorb

2楼2014-04-27 20:17:34
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zal7891

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-04-27 20:17:34
看看这个,默认的N参数找不到线性化能量,我换成lapw基组了。
elk.in

tasks
  0

stype
  0

swidth
  0.01

lradstp
  2

xctype
  20 0 0

trimvg
  .true.

gmaxvr
  14.0

nrmtscf
  ...

谢谢锐利的碎片的回复,用你的参数自洽计算可以进行了。非常感谢!
但是不知道具体哪些参数控制lapw基组的使用,是elk.in中的参数autolinengy吗?还是需要修改species文件呢?
目前在尝试ELK的几何优化功能,不知道对这样的体系优化的结果是否会可靠。
我思故我在!
3楼2014-04-29 20:10:35
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

引用回帖:
3楼: Originally posted by zal7891 at 2014-04-29 20:10:35
谢谢锐利的碎片的回复,用你的参数自洽计算可以进行了。非常感谢!
但是不知道具体哪些参数控制lapw基组的使用,是elk.in中的参数autolinengy吗?还是需要修改species文件呢?
目前在尝试ELK的几何优化功能,不知 ...

rgkmax, gmaxvr, lmaxapw, lmaxvr是控制平面波的。species里面设的是local orbital和apw,一般不用改,要看明白可以看http://www.springer.com/west/hom ... 10041-22-86705782-0 这本书,论坛里有下载。
4楼2014-05-01 17:14:00
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