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空蓝Y劫

新虫 (小有名气)

[求助] 求菌种鉴定方法详述 已有9人参与

药厂环境菌及工艺用水捡出的各类菌,需要鉴定种类,具体品种。现求菌种鉴定的各类方法,优缺点,适用范围,以及相应的仪器设备大体成本等,越详细越好。求大神帮忙。
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licunyu

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励新虫应助! 2014-04-23 17:57:39
制备分离培养基—培养—挑单菌落(dd H2O直接破裂菌体)—16s通用引物PCR—跑胶—切胶回收—连接转化—测序(16srRNA)—回执结果比对
2楼2014-04-23 08:37:39
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吹着泡泡的夏

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励新虫应助! 2014-04-23 17:58:35
还是分子的方法比较可靠 快速 种类鉴定多
走着走着就长大了
3楼2014-04-23 15:41:00
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


dllchina: 金币+1, good, 2014-05-01 21:34:29
你这样的应该找公司做!
致良知
4楼2014-04-23 16:13:50
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gemgem

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

用一个营养丰富的培养基,例如BHI,然后挑不同形态菌落,纯化,提取基因组,PCR,胶回收的产物拿去测序,这样更省钱,就是结果没有克隆的好,但是也有很多能鉴定到种。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2014-04-29 20:43:08
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空蓝Y劫

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by gemgem at 2014-04-29 20:43:08
用一个营养丰富的培养基,例如BHI,然后挑不同形态菌落,纯化,提取基因组,PCR,胶回收的产物拿去测序,这样更省钱,就是结果没有克隆的好,但是也有很多能鉴定到种。

首先谢谢大侠,因为是刚接触这个东西,提取基因组时候,选用市面上提取基因组DNA的试剂盒可以吗?(比如生工的)。还有PCR时候那个引物,是需要自己设计还是是一个已知固定的引物?谢谢!
6楼2014-05-01 14:26:48
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 空蓝Y劫 at 2014-05-01 14:26:48
首先谢谢大侠,因为是刚接触这个东西,提取基因组时候,选用市面上提取基因组DNA的试剂盒可以吗?(比如生工的)。还有PCR时候那个引物,是需要自己设计还是是一个已知固定的引物?谢谢!...

这个你应该去看看原核系统分类学的相关资料~
7楼2014-05-01 21:34:18
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亡佚

至尊木虫 (正式写手)

玩细胞的小逗逼~

【答案】应助回帖

划线挑单菌落,做个菌落PCR,用rDNA做模板,这个保守。P出来再测序下~
凡所有相,皆為虛妄。
8楼2014-05-06 20:27:35
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andylihuilai

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

菌种鉴定是一个系统工程,不是现学现卖的活,建议找家鉴定机构帮你做吧,我推荐CICC,因为他们给的结果比较详细,方便学习
9楼2014-07-28 14:42:50
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499649610

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果只是16S rDNA测序的话,直接用通用引物就行,但是越来越多的基因组解析表明,16srDNA在很多菌株内为非单拷贝存在的,不过可以用来做个参考,基本能确定到属。由于很多微生物为不可培养微生物,直接选取样品提取总DNA样品比培养后一个个测序更能说明问题。
10楼2014-07-28 17:01:56
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