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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 热点前沿问题讨论 » 反应机理的过渡态搜索
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dongabcde

银虫 (小有名气)

[求助] 反应机理的过渡态搜索已有1人参与

各位友友好，是不是算一种小分子氧化或者还原反应机理时，要先猜测一下反应的路径，然后在在猜测的基础上去搜索过渡态，求高手指点如何算出反应机理
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1楼2014-04-03 11:40:22
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王凯0370

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dongabcde: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-04-23 09:03:07
反应路径最好根据文献定，然后在起始物和产物之间进行搜寻过渡态。具体是还原还是氧化还跟反应气氛有关系的。
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2楼2014-04-03 22:06:14
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dongabcde

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 王凯0370 at 2014-04-03 22:06:14
反应路径最好根据文献定，然后在起始物和产物之间进行搜寻过渡态。具体是还原还是氧化还跟反应气氛有关系的。

你好，感谢你的回帖，我还有个问题，就是在进行第一次原子配对时，是对起始物和最终产物进行配对吗，还是起始物和你看文献得到的中间的某一物质进行配对呢，还有就是我算的是小分子物质的氧化没有相关的参考文献可以参考。
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3楼2014-04-23 09:08:30
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王凯0370

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by dongabcde at 2014-04-23 09:08:30
你好，感谢你的回帖，我还有个问题，就是在进行第一次原子配对时，是对起始物和最终产物进行配对吗，还是起始物和你看文献得到的中间的某一物质进行配对呢，还有就是我算的是小分子物质的氧化没有相关的参考文献可 ...

不知道你说的这个配对儿是啥意思，不知道是不是在每一步反应物和生成的产物进行插点搜寻过渡态。如果是的话就肯定是反应物和每一步的产物进行配对儿。还有就是没有氧化相关的文献是不是氧化路径难以进行或者根本就没有氧化路径。如果是这样的话我感觉最好还是先试着算一下还原路径，让自己对整个过程有所了解然后再进行氧化路径的探索（如果有必要的话）。不知道是不是你想问的问题。如果不是的话那就不还意思啊！！
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4楼2014-04-23 09:56:09
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dongabcde

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 王凯0370 at 2014-04-23 09:56:09
不知道你说的这个配对儿是啥意思，不知道是不是在每一步反应物和生成的产物进行插点搜寻过渡态。如果是的话就肯定是反应物和每一步的产物进行配对儿。还有就是没有氧化相关的文献是不是氧化路径难以进行或者根本就 ...

嗯，谢谢就是你说的那样，我所算的是乙炔的氧化反应机理，我知道反应物和最终产物，但是中间的过渡态没有相关的参考文献可以参考，那我就试着先算一下还原，还有我用的是纯金属做催化剂，想建一个4层（2x2）的平板模型，在切面之后surface Mesh里面有个u和v那个还需要设置吗，不知道哪个u和v有神魔影响，想问大侠你有没有做过，
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5楼2014-04-23 10:14:39
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王凯0370

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dongabcde: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-04-23 11:32:17
那个是确定你的面是哪个原子为边界的，也就是在可视化图形软件里看到的底物以什么样的方式到达边界。我做的金属氧化物是这样的。你算的是纯金属应该不会有这个问题的。你可以用不同的值切一下试试，看看到底有什么不同。这样的话能切个两三次估计就能明白每个参数的作用了。
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6楼2014-04-23 10:40:35
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