应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 质粒基因分析
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
91/1返回列表
查看: 1340  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jsxzzxj

铜虫 (初入文坛)

[求助] 质粒基因分析 已有3人参与

现有质粒全测序，结果已经出来了，我应该用什么软件区分析它？genbank 里面的blast只能找出序列相近或一样的，我应该用什么软件对里面的各种元件进行分析？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-03-30 21:18:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-08-01 16:43:22
还是找到质粒的图谱吧。。。
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-30 23:06:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有些公司提供质粒常见元件的序列表
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-31 09:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

研究室新生

铜虫 (小有名气)
请问你质粒全序列测定用的是什么方法啊？周期要多长呢？
赞一下 回复此楼
人生是一棵不停生长的树。
4楼2014-08-01 12:29:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-08-01 16:43:27
试下Vector NTI，可以分析酶切位点等。
对里面的各种元件进行分析的话，你得有载体图谱才好分析。
赞一下 回复此楼
5楼2014-08-01 15:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsxzzxj

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-03-30 23:06:17
还是找到质粒的图谱吧。。。

我刚刚拿到结果，已经进行了GOG、GO、Pathway 注释，不晓得下一步该如何继续分析，比如我想找出backbone mosaion区域，如何判断该质粒的类型等一系列继续分析的问题，感谢指导
赞一下 回复此楼
6楼2014-08-12 11:33:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsxzzxj

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-31 09:31:48
有些公司提供质粒常见元件的序列表

我刚刚拿到结果，已经进行了GOG、GO、Pathway 注释，不晓得下一步该如何继续分析，比如我想找出backbone mosaion区域，如何判断该质粒的类型等一系列继续分析的问题，如何找到转座子或整合子之类的，感谢指导
赞一下 回复此楼
7楼2014-08-12 11:34:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsxzzxj

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 鬼羽帝魂 at 2014-08-01 15:22:02
试下Vector NTI，可以分析酶切位点等。
对里面的各种元件进行分析的话，你得有载体图谱才好分析。

我这个是全质粒高通量测序，我刚刚拿到结果，已经进行了GOG、GO、Pathway 注释，不晓得下一步该如何继续分析，比如我想找出backbone mosaion区域，如何判断该质粒的类型等一系列继续分析的问题，感谢指导
赞一下 回复此楼
8楼2014-08-12 11:35:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsxzzxj

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 研究室新生 at 2014-08-01 12:29:32
请问你质粒全序列测定用的是什么方法啊？周期要多长呢？

用的上海生工的高通量测序，因为是野生质粒，45kb左右，时间一个半月。
赞一下 回复此楼
9楼2014-08-12 11:37:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jsxzzxj 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂！生物与医药专硕 +5 逆转陆先生 2026-04-01 6/300 2026-04-06 12:49 by lys0704
[考研] 0703总分331求调剂 +10 ZY-05 2026-04-04 14/700 2026-04-06 11:51 by xhai2011
[考研] 工科370求调剂 +3 溏心煎鸡蛋 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:55 by 这是一个无聊的�
[考研] 312求调剂 +9 gtw1 2026-04-06 9/450 2026-04-06 09:19 by cql1109
[考研] 化学0703-一志愿211-338分求调剂 +8 vants 2026-04-05 8/400 2026-04-06 06:17 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +11 熊二想上岸 2026-04-04 11/550 2026-04-05 22:21 by 醉翁wl
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-30 10/500 2026-04-05 17:57 by jj987
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:24 by 544594351
[考研] 求 +5 化工专硕323分 2026-04-04 5/250 2026-04-05 08:02 by 544594351
[考研] 323求调剂 +8 李佳乐1 2026-04-04 8/400 2026-04-04 22:26 by hemengdong
[考研] 311求调剂 +20 zchqwer 2026-04-01 22/1100 2026-04-03 22:09 by lglzsd
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 抱歉 +5 田洪有 2026-03-30 5/250 2026-04-03 10:24 by linyelide
[考博] 申博求助 +3 Reee1Llll 2026-04-01 3/150 2026-04-02 22:29 by 这是一个无聊的�
[考研] 085600，320分求调剂 +6 大馋小子 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:54 by dongzh2009
[考研] 一志愿华南师范大学-22408计算机-292分-求华南师范大学调剂 +4 爱读书的小鳄鱼 2026-04-02 4/200 2026-04-02 18:35 by 求调剂zz
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 301求调剂 +8 axibli 2026-04-01 8/400 2026-04-01 09:51 by 我的船我的海
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭