| 查看: 2794 | 回复: 3 | ||
WJ-MS新虫 (小有名气)
|
[求助]
VMD可视化键
|
|
我的体系是一堆原子，计算的时候是没有键的，但是我想看看体系配位情况，就另外添加了键（自定义的，假设AB原子之间的距离小于一个值，就存在一个键），现在关于原子和键的描述写在了一个文件里面，但是这个VMD打不开，后来摸索了一下，加了几句头文件， ITEM: TIMESTEP 2000 ITEM: NUMBER OF ATOMS 90 ITEM: NUMBER OF BONDS 130 ITEM: BOX BOUNDS pp pp pp 0 24.21 0 24.21 0 24.21 可以显示出原子，但是我定义的键还是不能显示出来，哪位高人能不能指点一下，怎么做才能把这些键也自定义出来？ |
回复此楼» 猜你喜欢
288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工
已经有10人回复
-
调剂0855-288
已经有5人回复
-
电子信息调剂交叉学科有推荐吗
已经有6人回复
-
266求调剂
已经有6人回复
-
材料科学与工程考研
已经有10人回复
-
283分材料与化工求调剂
已经有29人回复
-
一志愿哈尔滨工业大学085600英一数二337分求调剂
已经有4人回复
-
材料调剂
已经有11人回复
-
268求调剂
已经有8人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有23人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图
已经有12人回复
- 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
已经有14人回复
- 请问一步有500百万个原子的lammps构型文件用什么软件可以可视化显示？
已经有8人回复
- lammps文件可视化问题
已经有14人回复
- 哪种软件可以如何实现体系中某些分子动？
已经有4人回复
- VMD怎么显示模拟盒子的边界？
已经有6人回复
- 使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
已经有14人回复
- 关于VMD可视化的问题
已经有5人回复
- 使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
已经有30人回复
- 用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、大脑
已经有16人回复
- lammps可视化？
已经有5人回复
- 【500金币本版活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享”
已经有82人回复
- 【求助成功】XDATCAR怎么看？
已经有17人回复
- 【求助】VMD显示振动光谱
已经有3人回复
- 【求助】只是优化后文件，没有restart文件，能继续跑吗
已经有22人回复
- 【求助】请问orca的可视化软件有什么？
已经有7人回复
2楼2014-03-12 16:29:36
WJ-MS
新虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1559.2
- 散金: 100
- 帖子: 194
- 在线: 92.5小时
- 虫号: 1697144
- 注册: 2012-03-17
- 性别: MM
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2014-03-12 18:45:54
4楼2014-03-12 22:56:40
