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WJ-MS新虫 (小有名气)
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VMD可视化键
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我的体系是一堆原子,计算的时候是没有键的,但是我想看看体系配位情况,就另外添加了键(自定义的,假设AB原子之间的距离小于一个值,就存在一个键),现在关于原子和键的描述写在了一个文件里面,但是这个VMD打不开,后来摸索了一下,加了几句头文件, ITEM: TIMESTEP 2000 ITEM: NUMBER OF ATOMS 90 ITEM: NUMBER OF BONDS 130 ITEM: BOX BOUNDS pp pp pp 0 24.21 0 24.21 0 24.21 可以显示出原子,但是我定义的键还是不能显示出来,哪位高人能不能指点一下,怎么做才能把这些键也自定义出来? |
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2楼2014-03-12 16:29:36
WJ-MS
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