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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 构建一个带GST标签的载体，提取蛋白，设计引物时以cDNA为模板还是以CDS为模板呢？
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xy656691

金虫 (正式写手)

[求助] 构建一个带GST标签的载体，提取蛋白，设计引物时以cDNA为模板还是以CDS为模板呢？ 已有2人参与

个人觉得应该是cDNA，因为提取RNA之后反转录出来的是CDNA，而CDS虽说是也是蛋白质的编码序列，但是以CDS为模板设计的引物不一定能在CDNA里扩增出东西吧！还有CDNA和CDS之间的区别是什么呢？看了网上的一些答案，还不是太明白。
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1楼 2014-03-11 10:18:56
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xy656691: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-03-29 17:43:08
CDS是编码序列，cDNA是mRNA反转出来的，从NCBI上我们不难发现CDS在mRNA序列内。以CDS为模板设计的引物一定能在cDNA里扩增出东西。cDNA和CDS之间的区别是cDNA序列包括CDS以及UTR区域，CDS只是编码区。
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hehe
3楼2014-03-12 23:52:49
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-12 19:11:53
cDNA是互补DNA，是以mRNA为模版逆转录合成的片段，CDS是蛋白编码区。如果逆转录效果好，那CDS就必定包含在cDNA里头。如果要做表达，那就必须以CDS为模版设计引物。
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2楼2014-03-12 13:38:29
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xy656691

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-12 23:52:49
CDS是编码序列，cDNA是mRNA反转出来的，从NCBI上我们不难发现CDS在mRNA序列内。以CDS为模板设计的引物一定能在cDNA里扩增出东西。cDNA和CDS之间的区别是cDNA序列包括CDS以及UTR区域，CDS只是编码区。

恩，谢谢啦。用CDS序列设计的引物，以CDNA为模板扩增的PCR，载体已经构建出来了。
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4楼2014-03-29 17:43:10
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