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利用VASP进行收敛性测试,循环计算中途停止问题
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本人刚刚开始接触VASP,想测试FCC Ni的截断能,但是提交任务后程序总是中途停止,想请各位大侠帮忙看看问题出在哪里。下面是相关的输入文件: 1、POSCAR FCC Ni 1.0 3.5299999714 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 3.5299999714 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 3.5299999714 4 Direct 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.500000000 0.500000000 0.500000000 0.000000000 0.500000000 0.500000000 0.500000000 0.000000000 2、KPOINTS (由于是先测试ENCUT,所以KPOINTS设定了一个相对较大的值) Automatic 0 Monkhorst-Pack 25 25 25 0 0 0 3、POTCAR POTCAR是根据User's Guide第10章中给出的推荐值 4、INCAR 这里的INCAR文件使用PBS脚本文件代替 #PBS -l nodes=2:ppn=8 NPROC=`wc -l $PBS_NODEFILE|cut -f1 -d" "` cd $PBS_O_WORKDIR for a in 250 300 350 400 450 500 550 600 650 700 750 800 do rm -f WAVECAR cat >INCAR<<! SYSTEM = FCC Ni ISTART = 0; ICHARG = 2 ENCUT = $a PREC = Accurate ISMEAR = -5 NSW = 0; IBRION = -1 ISPIN = 2 ! echo a=$a /public/software/mpi/openmpi1.3.4-intel/bin/mpirun -mca btl openib,self -np $NPROC /public/software/vasp/vasp-openmpi-ifort E=`tail -1 OSZICAR` echo $a $E>>result done 现在的问题是提交任务之后程序会运行一段时间,但是过一会就停止了,并没有跑完所有设定的循环值,WAVECAR为0K,并给出下面的提示: a=300 running on 16 nodes distr: one band on 1 nodes, 16 groups vasp.4.6.28 25Jul05 complex POSCAR found : 1 types and 4 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup FFT: planning ... 1 reading WAVECAR entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) 16 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup) 另一个输出文件给出这样的信息 =>> PBS: job killed: walltime 3641 exceeded limit 3600 mpirun: killing job... -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that process rank 0 with PID 20528 on node node13 exited on signal 0 (Unknown signal 0). -------------------------------------------------------------------------- mpirun: clean termination accomplished 我在这里纠结一天多了,连个截断能都没算出来,还请各位大侠帮忙找找问题啊~ |
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