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apis_florea

木虫 (正式写手)

[求助] 细菌16S文库构建时怎么选择内切酶 已有2人参与

求助!构建昆虫肠道细菌16S文库构建时,挑完白斑做菌液PCR后,文献中都提到用内切酶来先酶切一下,根据酶切的分型每一种挑几个来测序,但我研究的昆虫的文献中在16S文库中没有提用哪种酶来切,只是在做TRFLP(限制性片段长度多态性)中用的是HaeⅢ  酶切然后做毛细管电泳,所以想请教下,在16S文库构件时,选择内切酶时到底选哪种?选择的依据是什么?非常感谢!
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
dllchina: 金币+1, 鼓励应助 2014-02-25 14:35:14
这个应该问题不大,酶切的目的只是初聚类,减少测序量,你选择的那一种应该就可以了。祝好
但行好事,莫问前程
3楼2014-02-25 13:29:24
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bikexmx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dllchina: 金币+1, 鼓励应助 2014-02-25 14:35:03
apis_florea: 金币+5, 有帮助 2014-02-25 16:30:35
我当时做的是用了两种内切酶Hin6I和BsuRI,就是选择酶切位置/碱基不一样的就行
前方总有更多挑战,战胜恐惧,勇往向前,加油~~~~
2楼2014-02-25 10:49:39
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