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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 网络生活区 » 有奖问答 » 学术帮助 » 关于寻找启动子的问题
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yuan_0059

金虫 (初入文坛)

[求助] 关于寻找启动子的问题

最近RACE到一个基因，有5端帽子结构和3端Poly A尾巴，没有标准的翻译框架，BLAST也没有比对到相似序列，很是棘手，求大神指点一二怎么分析。
另外我想找到这个基因的启动子区，应该是个什么思路？由于没有对比，所以我很茫然。
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1楼 2014-02-22 12:58:03
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

给你传了个文档，文档后面有几个网站，http://www.epd.isb-sib.ch/输入基因名称就可以找到启动子序列。
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  • 附件 1 : 如何查找一个基因的启动子序列-UCSCGenomeBioinformatics.doc
    • 2014-02-22 13:20:58, 164 K
青山不断，绿水长流
2楼2014-02-22 13:21:33
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yuan_0059

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by HYZ221314 at 2014-02-22 13:21:33
给你传了个文档，文档后面有几个网站，http://www.epd.isb-sib.ch/输入基因名称就可以找到启动子序列。

你发的那个文档我在网上看了，没看太懂。我的基因因为在网上找不到相似序列，所以该基因没有被命名。所以不知道怎么下手。
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3楼2014-02-22 13:26:19
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

是真核还是原核的？找到启动子密码子，前面的就是咯。这个估计准确性不高，所以你可以多设计几个
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青山不断，绿水长流
4楼2014-02-22 15:36:08
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
yuan_0059: 金币+1, ★有帮助, 谢谢 2014-04-18 13:50:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by HYZ221314 at 2014-02-22 15:36:08
是真核还是原核的？找到启动子密码子，前面的就是咯。这个估计准确性不高，所以你可以多设计几个

嗯，我看错了，真核生物的……

[ 发自小木虫客户端 ]
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青山不断，绿水长流
5楼2014-02-23 17:59:10
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