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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 在用vasp进行表面吸附时,遇到的问题,求高手解惑! 已有4人参与

各位前辈大家好:
我在模拟一篇文献上的CO和H在Ni表面吸附时,遇到一个问题,很是困惑,文献上要求计算吸附能,给出公式Eads=Erelaxed+ECO+1/2EH2-ENi(111)-p(2x2)-CO+H,这就需要用vasp计算CO和氢气的能量,我就想着先优化一下CO和氢气的结构,然后求能量,但在建立poscar时首先知道碳氧键的键长和氢氢键的键长,问题是这个键长怎么确定,文献上也没告诉呀,难道这个是有一个国家统一标准值吗?还有在进行表面吸附时,还须知道碳镍键长,氢镍键长,这些又是怎么确定的,难道也已经有了一个规定好的标准值了吗?这个问题不解决,我下一步无法进行,望高手帮忙,谢谢了!
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孙远慧

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2014-01-20 22:11:08
小小鑫000: 金币+3, 有帮助 2014-01-22 10:01:26
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-01-19 21:18:55
前辈,我这样加原子,没有出现键呀!您能不能详细给我说说怎么加原子?就是我点那个add atoms,加氧原子,会让我自己输入xyz值,也就是自己确定键长呀,还望前辈教导!...

最下面那个元素周期表。你先添加一个Ni,然后在上面添加一个H就行了,多尝试几次就会用了
在用vasp进行表面吸附时,遇到的问题,求高手解惑!
2014-01-20_13-37-40.jpg

dsfgdsgsfd
8楼2014-01-20 13:40:11
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-20 22:11:02
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   CO bond length, 1.12 A (?????Y????????e???)
   1) "Microwave Spectroscopy in the Region from Two to Three Millimeters". Physical Review 78 (2): 140. (1950)
   2) (2010). Handbook of Chemistry and Physics (91 ed.). Boca Raton, Florida: CRC Press. p. 9?C33. ISBN 978-1439820773.

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7楼2014-01-20 06:33:24
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孙远慧

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by skydark at 2014-01-20 16:20:30
大姐  想請教一下  您這ms添加原子的程式要到哪下載啊?
ms是指Material Studio嗎?...

软件自带的就有啊,我的是MS5.5的,低版本的应该也有。我是92年的男生,不是大姐,呵呵~~~
dsfgdsgsfd
10楼2014-01-21 11:47:23
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普通回帖

gump_813

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+1 2014-01-19 19:25:16
键长不是优化结构得到的吗?
2楼2014-01-19 12:54:24
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+2, 有帮助 2014-01-19 20:43:33
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-20 22:10:48
CO 和 H2的bond length 采用实验值  自己查找相关手册

表面优化初始C-Ni H-Ni键长粗略地可以设置 实验值的1.5~2倍
3楼2014-01-19 15:09:34
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孙远慧

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-01-19 21:09:30
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-20 22:10:54
ms里面有个添加原子的,你可以先加入一个原子,点下那个键,之后就会自动给出一个长度,就用那个就行。别和我说你不知道怎么加原子。
dsfgdsgsfd
4楼2014-01-19 19:16:36
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 孙远慧 at 2014-01-19 19:16:36
ms里面有个添加原子的,你可以先加入一个原子,点下那个键,之后就会自动给出一个长度,就用那个就行。别和我说你不知道怎么加原子。

前辈,我这样加原子,没有出现键呀!您能不能详细给我说说怎么加原子?就是我点那个add atoms,加氧原子,会让我自己输入xyz值,也就是自己确定键长呀,还望前辈教导!
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5楼2014-01-19 21:18:55
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skydark

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-20 07:43:08
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6楼2014-01-19 23:21:04
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skydark

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 孙远慧 at 2014-01-20 13:40:11
最下面那个元素周期表。你先添加一个Ni,然后在上面添加一个H就行了,多尝试几次就会用了

2014-01-20_13-37-40.jpg
...

大姐  想請教一下  您這ms添加原子的程式要到哪下載啊?
ms是指Material Studio嗎?
9楼2014-01-20 16:20:30
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