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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用DS对含有非氨基酸结构的蛋白进行建模
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dingding9631

金虫 (小有名气)

[求助] 用DS对含有非氨基酸结构的蛋白进行建模 已有2人参与

楼主要建模的蛋白，模板序列中有非氨基酸结构（三个氨基酸自身环化）。DS同源建模时，无法得到这种结构。请问各位，有办法把非氨基酸连到肽链上去吗？我想把那种结构定义成特殊氨基酸导入DS,然后模拟突变。搞了好长时间都没成功。
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1楼 2014-01-04 18:05:22
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dingding9631

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞雪城飞雪 at 2014-01-20 09:40:44
请问你用的是哪个版本的ds

DS2.5
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3楼2014-01-20 13:59:51
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飞雪城飞雪

金虫 (小有名气)
请问你用的是哪个版本的ds

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2014-01-20 09:40:44
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-23 16:18:53
本帖内容被屏蔽
4楼2014-01-22 21:46:42
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-11 18:34:33
个人觉得是DS 2.5本身缺陷，对这种非标准氨基酸完全搞不定，你不妨换个其他软件试试，甭纠结了，那个版本太老
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
5楼2014-03-11 17:11:52
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