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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » CADD新手，求助用chembio3D如何对小分子进行优化？
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zd啦啦啦

木虫 (小有名气)

[求助] CADD新手，求助用chembio3D如何对小分子进行优化？ 已有2人参与

新手，请写的详细些，多多益善。谢过各位前辈！
另外，优化后保存成sdf格式和pdb格式有什么区别么？

[ Last edited by zd啦啦啦 on 2013-12-31 at 18:33 ]
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1楼 2013-12-31 13:22:00
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-03 16:58:54
zd啦啦啦(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导！ 2014-05-31 20:36:07
如何优化的问题看手册吧，要学软件主要功夫还是靠自己，不可能什么都在这里问；两种格式只是跟其他多种软件兼容的需要
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有志者，事竟成。
2楼2014-01-03 11:17:12
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

主要是在chemi3D里面进行能量最小化，minimum energy！后续可以保存成mo2文件，进行autodock分子对接
赞一下 回复此楼
3楼2014-01-12 10:20:11
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