应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 动力学NPT压力
261/1返回列表
查看: 5479  |  回复: 25
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

[交流] 动力学NPT压力

最近用vasp 5.2.12做NPT的MD模拟 以下是INCAR
ISTART = 0
INIWAV = 1

ISYM = 0

ENCUT = 800
ENAUG = 2400
PREC = high
MAXMIX = 40
EDIFF = 0.001
NELMIN = 4

ISMEAR = -1
SIGMA = 0.172

IBRION = 0
LREAL = .FALSE.

ALGO = Very Fast

NSW = 1000

LCHARG = .FALSE.
LWAVE = .TURE.
TEBEG = 2000.0
TEEND = 2000.0

SMASS = 0
NBLOCK = 50
POTIM = 1.0

PSTRESS = 1500
ISIF = 3

PMASS = 20

DMALGO = 3
LANGEVIN_GAMMA = 50,50,50
LANGEVIN_GAMMA_L = 50

提取OUTCAT中stress信息如下

in kB 4172.66112 3902.39396 4400.48371 0.75775 0.00033 -0.00129
in kB 4175.23568 3903.55126 4397.35739 -1.09890 4.17513 0.79122
in kB 4177.58431 3902.41118 4388.94827 -1.87095 8.17570 1.01140
in kB 4180.84173 3901.55583 4377.15279 -2.23297 11.91227 0.64589
in kB 4183.17536 3899.89882 4361.25600 -1.97631 15.42282 -0.17552
in kB 4184.61089 3897.95280 4341.75406 -1.03387 18.65903 -1.31153
in kB 4184.97713 3895.89317 4319.14836 0.60726 21.60255 -2.56697
in kB 4183.96156 3893.68236 4293.78485 2.78659 24.21068 -3.74790
in kB 4181.50387 3891.18446 4266.20603 5.28728 26.42985 -4.67963
in kB 4177.77326 3888.18529 4237.08118 7.81475 28.20301 -5.22024
in kB 4173.13620 3884.51263 4207.21849 10.00879 29.47044 -5.27320


我的问题是
为什么设置PSTRESS = 1500，但是OUTCAR却给出压力在4000左右？

如果只是普通的结构优化，设置IBRION = 2，stress信息如下

in kB 4164.18638 3891.83071 4390.16931 -0.00023 0.00009 0.00002
in kB 3839.38224 3590.92924 4038.54882 0.00163 -0.00007 -0.00002
in kB 2996.27502 2807.91069 3130.59147 -0.00024 -0.00002 -0.00013
in kB 1778.69087 1669.38225 1831.87127 -0.00002 0.00001 -0.00004
in kB 1497.67446 1404.55014 1534.81292 0.00048 -0.00002 0.00006
in kB 1448.12627 1357.76865 1482.58460 0.00035 0.00002 -0.00004
in kB 1449.96058 1361.96624 1487.14790 0.00273 0.00009 0.00010
in kB 1456.56412 1374.89207 1499.80704 0.00234 -0.00000 0.00001
in kB 1477.63406 1406.94473 1524.00978 -0.00029 -0.00005 0.00003
in kB 1548.88679 1500.03893 1572.79441 -0.00230 -0.00005 0.00007
in kB 1803.80977 1850.93418 1743.05711 -0.00311 0.00001 0.00025

....

in kB 1500.08061 1499.76833 1499.91247 0.00031 -0.00003 -0.00000
in kB 1499.86822 1499.56459 1499.69498 -0.00016 -0.00000 0.00002
in kB 1499.96526 1499.79712 1500.02728 0.00052 -0.00003 0.00000
in kB 1500.17449 1500.27199 1500.67246 0.00043 -0.00001 -0.00002
in kB 1499.88523 1500.04832 1500.34787 -0.00023 -0.00001 -0.00003
in kB 1499.30292 1499.59149 1499.70567 -0.00008 -0.00000 -0.00003
in kB 1499.58503 1499.88517 1499.85329 -0.00014 0.00002 -0.00004
in kB 1500.29745 1500.58586 1500.17384 -0.00009 0.00002 0.00000
in kB 1500.10129 1500.25323 1499.81734 0.00016 0.00004 0.00002
in kB 1500.08360 1500.17931 1499.73520 0.00020 0.00001 0.00001
in kB 1500.07581 1500.15166 1499.90178 0.00048 0.00001 -0.00001
in kB 1500.07394 1500.13570 1500.00074 0.00028 0.00001 0.00000

这个压力是正确的。

为什么做动力学的时候 （IBRION = 0）压力显示为4000多？
多谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

计算模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-12-09 20:17:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

锐利的碎片

木虫 (正式写手)
★
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
计算时候用压力下的平衡结构做初始结构，一般MD压力平衡会比较困难。
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-09 20:33:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2013-12-09 20:33:38
计算时候用压力下的平衡结构做初始结构，一般MD压力平衡会比较困难。

谢谢回复。
MD中使用的初始结构就是该压力的平衡结构。
我测试了一下，不管Pstress设置为多少，OUTCAR中的压力都显示为4000左右。
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-09 20:52:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

假大空

木虫之王 (文学泰斗)
★
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
??
回复此楼
7楼2013-12-09 21:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
liutao_jlu822: 金币+5, 给个红包，谢谢回帖 2013-12-10 15:04:22
明显你给的结构是400GPa左右的。
楼主你把relax之后的CONTCAR作为初始结构就好了。另外感觉是不是楼主的POTIM = 1.0设的太小了，那个单位是fs。
喔，我刚才查了一下，vasp不能做vc-md（cpmd），那估计就没办法做NPT系综了。
注意下面那个manual最下面的mind：
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/IBRION_0.html

[ Last edited by dxcharlary on 2013-12-10 at 09:01 ]
赞一下 回复此楼
18楼2013-12-10 08:53:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

锐利的碎片

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
liutao_jlu822: 金币+5, 给个红包，谢谢回帖 2013-12-10 15:04:53
引用回帖:
18楼: Originally posted by dxcharlary at 2013-12-10 08:53:45
明显你给的结构是400GPa左右的。
楼主你把relax之后的CONTCAR作为初始结构就好了。另外感觉是不是楼主的POTIM = 1.0设的太小了，那个单位是fs。
喔，我刚才查了一下，vasp不能做vc-md（cpmd），那估计就没办法做N ...

5.2.12加上-Dtbdyn编译后可以算npt，lz的INCAR是对的。
赞一下 回复此楼
19楼2013-12-10 10:21:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
liutao_jlu822: 金币+1, 给个红包，谢谢回帖 2013-12-10 15:05:52
引用回帖:
19楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2013-12-10 10:21:33
5.2.12加上-Dtbdyn编译后可以算npt，lz的INCAR是对的。...

请问vasp 4.6 能跑NPT吗？ 难道只能跑NVT？ 谢了啊
赞一下 回复此楼
20楼2013-12-10 11:35:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
liutao_jlu822: 金币+5, 给个红包，谢谢回帖 2013-12-10 15:05:36
引用回帖:
19楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2013-12-10 10:21:33
5.2.12加上-Dtbdyn编译后可以算npt，lz的INCAR是对的。...

嗯，看起来是这样。
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... vin_thermostat.html
不过1fs的时间间隔个人感觉还是有点短。

[ Last edited by dxcharlary on 2013-12-10 at 11:46 ]
赞一下 回复此楼
21楼2013-12-10 11:44:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by dxcharlary at 2013-12-10 08:53:45
明显你给的结构是400GPa左右的。
楼主你把relax之后的CONTCAR作为初始结构就好了。另外感觉是不是楼主的POTIM = 1.0设的太小了，那个单位是fs。
喔，我刚才查了一下，vasp不能做vc-md（cpmd），那估计就没办法做N ...

我查了一下我给的结构是relax之后的结构，不应该是400GPa的结构

Mind: At the moment only constant volume MD's are possible.
我看了一下体积，果然是constant volume。但是
在vasp manual 里面 也有NPT的介绍，说只要是ISIF=3就可以改变体积和形状
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... vin_thermostat.html

不知道怎么回事？
赞一下 回复此楼
23楼2013-12-10 15:45:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

锐利的碎片

木虫 (正式写手)
引用回帖:
23楼: Originally posted by liutao_jlu822 at 2013-12-10 15:45:11
我查了一下我给的结构是relax之后的结构，不应该是400GPa的结构

Mind: At the moment only constant volume MD's are possible.
我看了一下体积，果然是constant volume。但是
在vasp manual 里面 也有NPT的 ...

看19楼。
回复此楼
24楼2013-12-10 18:33:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
引用回帖:
24楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2013-12-10 18:33:21
看19楼。...

Thanks
回复此楼
25楼2013-12-10 18:56:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liutao_jlu822

银虫 (小有名气)
体积终于可以变化， 应该是 -Dtbdyn 编译问题，但是新问题有出现了。
我要在T=2000K, P=150GPa下进行模拟NPT系宗，但是在OUTCAR中系统压力无限制的增加到5000GPa，体积也缩小到不合理的范围。
以前用lammps做经典动力学NPT模拟的时候还真没碰上这种情况。大家看看那出错了呢？谢谢
赞一下 回复此楼
26楼2013-12-11 16:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
miaojiabing3楼
2013-12-09 20:48   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
天涯20124楼
2013-12-09 20:50   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
峰锋风逢烽6楼
2013-12-09 21:04   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
userhung8楼
2013-12-09 21:10   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
readytogo9楼
2013-12-09 21:10   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
jyjydd10楼
2013-12-09 21:20   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
zhangwei1911楼
2013-12-09 21:32   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
zhchzhsh207612楼
2013-12-09 21:39   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
boyuehu13楼
2013-12-09 21:44   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
pzchen14楼
2013-12-09 21:57   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
base0803030815楼
2013-12-09 21:58   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
westlife91116楼
2013-12-09 22:00   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
1
flyxu17楼
2013-12-09 22:05   回复  
liutao_jlu822(金币+2): 谢谢参与
Sammy222楼
2013-12-10 12:02   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 liutao_jlu822 的主题更新
261/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 288求调剂 +6 于海海海海 2026-03-19 6/300 2026-03-19 12:33 by peike
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +6 Ymlll 2026-03-18 9/450 2026-03-19 10:28 by 星空星月
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 354求调剂 +4 Tyoumou 2026-03-18 7/350 2026-03-18 21:45 by Tyoumou
[考研] 085601专硕，总分342求调剂，地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 一志愿西南交大，求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 26考研求调剂 +6 丶宏Sir 2026-03-13 6/300 2026-03-17 16:13 by 醉在风里
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习 +6 Losir 2026-03-12 7/350 2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 326求调剂 +4 诺贝尔化学奖觊� 2026-03-15 7/350 2026-03-16 17:11 by 诺贝尔化学奖觊�
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 招收0805（材料）调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭