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wm0629

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] 求解晶体，跪谢！

本人是外行，分出的新化合物打单晶后不会解析，还望给位大侠帮忙解析，感激不尽！若果能解出来还会追加金币的。

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附件 1 : x-衍射数据.zip

2013-12-05 15:19:04, 202.72 K

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艰难困苦，玉汝于成。

1楼 2013-12-05 15:19:16

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gkmuse

铁杆木虫 (正式写手)

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引用回帖:

9楼: Originally posted by 羊倌 at 2013-12-05 20:14:18
http://1000eb.com/rq9g

我解得结果。
checkcif

Alert level B
         Crystal system given = orthorhombic
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D    H1    ..  H2    ..    2.06 Ang.
Alert level C
STRVA01_ALERT_4_C          Flack parameter is too small
         From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack -1.000
         From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su 1.100
PLAT601_ALERT_2_C Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .       37 Ang3
PLAT790_ALERT_4_C Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #       1 Note
            C20 H34 O4
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF    Please Do !
PLAT007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms ..............       2 Why ?
PLAT032_ALERT_4_G Std. Uncertainty on Flack Parameter Value High .    1.100 Why ?
PLAT199_ALERT_1_G Reported _cell_measurement_temperature ..... (K)       293 Check
PLAT200_ALERT_1_G Reported _diffrn_ambient_temperature ..... (K)       293 Check
PLAT720_ALERT_4_G Number of Unusual/Non-Standard Labels ..........       10 Note
PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C4    .............       S Verify
And 7 other PLAT791 Alerts Less ...

PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C5 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C6 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C7 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C9 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C12 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C17 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C19 ............. S Verify

你解得结果。
checkcif

Alert level C
STRVA01_ALERT_2_C          Chirality of atom sites is inverted?
         From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack 1.900
         From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su 1.100
PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given .    Please Do !
PLAT601_ALERT_2_C Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .       37 Ang3
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF    Please Do !
PLAT007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms ..............       4 Why ?
PLAT032_ALERT_4_G Std. Uncertainty on Flack Parameter Value High .    1.100 Why ?
PLAT066_ALERT_1_G Predicted and Reported Tmin&Tmax Range Identical       ? Check
PLAT093_ALERT_1_G No su's on H-positions, refinement reported as .    mixed
PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C1    .............       R Verify
And 7 other PLAT791 Alerts Less ...

PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C3 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C5 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C6 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C7 ............. S Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C8 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C12 ............. R Verify PLAT791_ALERT_4_G The Model has Chirality at C16 ............. R Verify

我尝试好几次重新加氢，依然除不掉我的B类错误呢。
我们两者解出来的结构，恰成一对镜像呢！

Temp是你有意改的吗？原始数据里面是293的，你的是298。