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高斯优化构建的小分子,为什么每次优化后的坐标不完全相同?
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Trevor1983
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高斯优化构建的小分子,为什么每次优化后的坐标不完全相同?
写了一篇小论文,其中涉及用高斯软件对小分子进行结构优化,对一个碘分子用DFT进行结构优化,参数都是 scf=(maxcycle=9999,conver=6),为什么不同的初始距离最终优化结果坐标只有小数点前三位相同而后面不同啊?是什么原因啊?精度?怎么改关键词
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1楼
2013-11-28 10:51:09
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marson
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2013-11-28 20:58:53
gkf高: 金币+2
2013-11-28 22:25:54
不要看坐标,坐标是人为可以设定的,只要能量等一些表征分子构型的参数对就可以,或者看分子中的各个原子的相对距离,键角之类的~
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思想有多远,我们就能走多远~
6楼
2013-11-28 20:44:36
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2013-11-28 12:20:58
gmy1990: 金币+2
2013-11-28 16:04:56
个人观点,仅作参考:
坐标差这么点关系不大啊,毕竟初始结构不一样。而且光看坐标没有可比性的吧,看键长键角、能量等来比较是不是比较好?
另外maxcycle需要9999么?不是说500以上就无意义了么。。。。
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2楼
2013-11-28 11:25:42
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Trevor1983
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2楼
:
Originally posted by
枪下游魂
at 2013-11-28 11:25:42
个人观点,仅作参考:
坐标差这么点关系不大啊,毕竟初始结构不一样。而且光看坐标没有可比性的吧,看键长键角、能量等来比较是不是比较好?
另外maxcycle需要9999么?不是说500以上就无意义了么。。。。
请问一般涉及高斯优化的论文是不是需要把优化好的坐标作为补充材料上传?
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3楼
2013-11-28 12:25:13
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3楼
:
Originally posted by
Trevor1983
at 2013-11-28 12:25:13
请问一般涉及高斯优化的论文是不是需要把优化好的坐标作为补充材料上传?...
这个我不清楚,一般结构优化直接上图就行了吧?
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4楼
2013-11-28 12:44:53
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