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zhywind200铜虫 (正式写手)
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求助如何添加原子！！已有1人参与
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我下载了一个CIF文件，是含有结晶水的三氧化钨，对于这类三氧化钨，所有的CIF文件都是吧水的位置用氧原子代替的，也就是说这块的氢的位置应该是随机的。 我在这个氧上电价氢，一下子就出了4个键，也就是4个氢，于是就破坏对称性，但是这样一来，就不知道如何调整H-O键长和键角。求大神帮忙啊！！！！！！！ |
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10楼2013-12-12 09:56:04
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【答案】应助回帖
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自己打开cif学学 cif里标记了那种原子是需要加氢的 loop_ _atom_site_label _atom_site_type_symbol _atom_site_symmetry_multiplicity _atom_site_Wyckoff_symbol _atom_site_fract_x _atom_site_fract_y _atom_site_fract_z _atom_site_occupancy _atom_site_attached_hydrogens _atom_site_B_iso_or_equiv O5 O2- 4 a 0 0 0.690(8) 1. 2 1.25(6) 找出O5的位置 右键select symmetry images 右键display style 修改原子颜色好做标记 build——symmetry——make P1 选择刚才标记的原子，adjust hydrogen  |
13楼2013-12-20 10:24:21
pigrass
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