24小时热门版块排行榜    

查看: 2092  |  回复: 10

dx0620

木虫 (正式写手)

[求助] pwscf的原子坐标ATOMIC_POSITIONS设置

pwscf中输入原子坐标部分,我能直接用ms的*.cell文件中的原子坐标吗?能的话ATOMIC_POSITIONS后面{}我要填什么啊?
之前填的是crystal,但是我用xcrysden导入input文件,出来的结构跟ms里差很多
xcrysden中出现的
pwscf的原子坐标ATOMIC_POSITIONS设置
ms中建的模型
pwscf的原子坐标ATOMIC_POSITIONS设置-1
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

另附input
&system
     ibrav=11
     celldm(1)=8.653,
     celldm(2)=1.157
     celldm(3)=0.655,
     nat=10, ntyp=2
     ecutwfc=60
     ecutrho=720
     occupations='smearing', smearing='methfessel-paxton', degauss=0.03
     la2F =.true.
/
&electrons
     conv_thr= 1.0d-9
     mixing_beta = 0.7
/
ATOMIC_SPECIES
Fe 55.845 Fe.blyp-sp-van.UPF
B  10.811 B.blyp-n-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
Fe   0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000
Fe   0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.5000000000000000
  B   0.2486999928951263   0.3122999966144565  -0.0000000000000001
  B  -0.2486999928951263  -0.3122999966144565  -0.0000000000000001
  B   0.2513000071048737   0.8122999966144565   0.5000000000000000
  B   0.7486999928951265   0.1877000033855435   0.5000000000000001
  B   0.3411000072956085   0.1263000071048737   0.4999999999999999
  B  -0.3411000072956085  -0.1263000071048737   0.5000000000000000
  B   0.1588999927043915   0.6263000071048736   0.0000000000000000
  B   0.8411000072956086   0.3736999928951263   0.0000000000000000
K_POINTS {automatic}
16 16 28 0 0 0
2楼2013-11-20 22:13:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdonnie

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dx0620: 金币+7, ★★★很有帮助 2013-11-25 10:29:02
dx0620: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-11-25 14:32:29
ibrav=11是orthorhombic body centered,因为是体心的,所以导致你做出的结构里面多了好多红色的原子。貌似你应该改用orthorhombic primitive,也就是ibrav=8。另外乍一看去,楼主的ecutwfc取得好像太高,K点也过密。
3楼2013-11-25 09:34:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 09:34:24
ibrav=11是orthorhombic body centered,因为是体心的,所以导致你做出的结构里面多了好多红色的原子。貌似你应该改用orthorhombic primitive,也就是ibrav=8。另外乍一看去,楼主的ecutwfc取得好像太高,K点也过密 ...

ecutwfc我大概测试了下,50-60左右,这是第一步加密K点算的,所以比较密。我确定ibrav的时候从materials studio里看行吗?
pwscf的原子坐标ATOMIC_POSITIONS设置-2
4楼2013-11-25 10:28:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdonnie

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 10:28:09
ecutwfc我大概测试了下,50-60左右,这是第一步加密K点算的,所以比较密。我确定ibrav的时候从materials studio里看行吗?
...

我没用过materials studio,不晓得是否能从那里面直接看(能不能直接用肯定也取决于你在QE的input里的具体设置),不过至少可以作为一个参考的。 ibrav具体怎么取还要看具体情况,而且可能性往往不止一种。比如这里你也可以设置ibrav=0,然后指定crystal lattice vector,或者还可以把你的结构当作三斜的,指定a, b, c, alpha, beta, gamma,看个人爱好,以及如何设置方便。不过不管怎么说,楼主都要对程序里的结构参数以及要做的体系的实际结构有一个了解,才方便进行设置的。

关于ecutwfc,我不知道楼主为什么要加密K点,但我不认为加密K点就需要提高ecutwfc,貌似没有太大关系。
5楼2013-11-25 12:33:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 12:33:03
我没用过materials studio,不晓得是否能从那里面直接看(能不能直接用肯定也取决于你在QE的input里的具体设置),不过至少可以作为一个参考的。 ibrav具体怎么取还要看具体情况,而且可能性往往不止一种。比如这里 ...

我不是说提高ecutwfc是为的加密K点。我的ecutwfc经过收敛测试选取的;我是计算电声耦合,这里截取的input是第一步加密K点的计算
6楼2013-11-25 14:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 12:33:03
我没用过materials studio,不晓得是否能从那里面直接看(能不能直接用肯定也取决于你在QE的input里的具体设置),不过至少可以作为一个参考的。 ibrav具体怎么取还要看具体情况,而且可能性往往不止一种。比如这里 ...

再请问,pwscf中的输出文件中,能查看所建结构的空间群吗?
麻烦你了,谢谢~
7楼2013-11-25 15:14:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdonnie

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 15:14:38
再请问,pwscf中的输出文件中,能查看所建结构的空间群吗?
麻烦你了,谢谢~...

不能的,要用其他的软件分析查看。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2013-11-25 18:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 18:53:16
不能的,要用其他的软件分析查看。...

比如?我现在只知道xcrysden可以导入,但是它貌似也不能看空间群吧
9楼2013-11-25 19:43:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdonnie

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 19:43:11
比如?我现在只知道xcrysden可以导入,但是它貌似也不能看空间群吧...

一般的找对称性的软件,比如findsym。需要你利用原子坐标设置一个findsym的输入文件。
10楼2013-11-25 19:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dx0620 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 材料与化工专硕调剂 +3 heming3743 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:05 by peike
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 279求调剂 +3 抓着星星的女孩 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:47 by userper
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
信息提示
请填处理意见