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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 使用pwscf计算这个单胞的话 怎么数单胞中的原子数？
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topten-gg

银虫 (正式写手)

[求助] 使用pwscf计算这个单胞的话 怎么数单胞中的原子数？

REMARK   Materials Studio PDB file
REMARK   Created:  Tue Jan 03 14:07:02 ora solare Europa occidentale 2012
CRYST1   16.780   16.780    2.459  90.00  90.00 120.00 P1
ATOM      1  C   MOL     2       7.774   2.633   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM      2  C   MOL     2       5.336   5.786   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM      3  C   MOL     2       7.440   4.002   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM      4  C   MOL     2       7.067   4.605   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM      5  C   MOL     2       3.930   5.891   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM      6  C   MOL     2       3.242   5.723   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM      7  C   MOL     2       5.992   5.517   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM      8  C   MOL     2       1.584   4.442   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM      9  C   MOL     2       2.043   4.982   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     10  C   MOL     2       1.703   0.458   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM     11  C   MOL     2       1.050   3.137   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM     12  C   MOL     2       0.997   2.431   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     13  C   MOL     2       2.778  -0.453   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM     14  C   MOL     2       3.434  -0.722   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     15  C   MOL     2       1.331   1.061   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     16  C   MOL     2       5.528  -0.660   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM     17  C   MOL     2       4.840  -0.828   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     18  C   MOL     2       6.728   0.081   1.055  1.00  0.00           C   
ATOM     19  C   MOL     2       7.186   0.622   2.285  1.00  0.00           C   
ATOM     20  C   MOL     2       7.721   1.926   2.285  1.00  0.00           C   
TER


新手接触固体物理 很茫然
谢谢大家

直接用nat=20 ntyp=1？


谢了
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1楼 2012-01-03 22:22:43
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phq323

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示~~有帮助 2012-01-04 09:53:19
topten-gg(金币+2): 谢谢你 这个是triclinic ab相等不等于c alphabeta为90 gamma120 2012-01-04 18:45:14
可以这样设的，nat=20。
这个晶胞不是一个PWSCF默认的FCC、BCC、SC等标准的晶胞，需要自己设置。
赞一下(1人) 回复此楼
顶帖也是一种收获！
2楼2012-01-04 09:17:18
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流~~ 2012-01-04 14:24:44
topten-gg(金币+3): ★★★很有帮助 2012-01-04 18:41:12
直接把CASTEP的*.cell文件中BLOCK LATTICE_CART部分作为PWscf中的CELL_PARAMETER，再把BLOCK POSITIONS_FRAC中的部分作为PWscf的ATOMIC_POSITIONS不就可以了么……
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思想重于技巧，内涵重于表象
3楼2012-01-04 14:17:15
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topten-gg

银虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by souledge at 2012-01-04 14:17:15:
直接把CASTEP的*.cell文件中BLOCK LATTICE_CART部分作为PWscf中的CELL_PARAMETER，再把BLOCK POSITIONS_FRAC中的部分作为PWscf的ATOMIC_POSITIONS不就可以了么……

castep里面 cell parameter的单位是angstrom  
atomic position的单位是什么呢？
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4楼2012-01-04 18:54:32
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
WDD880227(金币+1): 感谢交流 2012-01-05 08:57:26
引用回帖:
4楼: Originally posted by topten-gg at 2012-01-04 18:54:32:
castep里面 cell parameter的单位是angstrom  
atomic position的单位是什么呢？

各种单位，参见DOC/中PW的帮助文件~
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2012-01-04 20:25:33
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★
fzx2008(金币+1): 谢谢指教 2012-01-04 21:01:06
在转换CASTEP到PWSCF的原子坐标时，要注意选择的是incell原子坐标，否则在pwscf中会出现原子重叠的现象。
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6楼2012-01-04 20:29:16
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tongji888

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
7楼2012-01-05 21:40:26
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-01-06 10:34:24
引用回帖:
7楼: Originally posted by tongji888 at 2012-01-05 21:40:26:
怎么确定自己选择的是不是incell的原子呢？请教。。。

输出格式为.car即可看到了
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2012-01-06 10:30:20
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