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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 如何快速的找出单胞中包含的原子个数而不遗漏
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信任开花

铁杆木虫 (知名作家)

[交流] 如何快速的找出单胞中包含的原子个数而不遗漏

如题：如何快速的找出单胞中包含的原子个数而不遗漏

碰到In2O3单胞
文献中描述为：body centered cubic bixbyite structure （space group Ia3¯ with 80 atoms in a unit cell.

但是我找到In2O3单胞的cif文件,make P1,得到：

  ( -0.778638184070587158203125000000E+00  0.597428441047668457031250000000E+00)
  (  0.212736517291034488152945414186E-08  0.205264694130846692132763564587E-08)
  ( -0.488785616425957414321601390839E-07  0.578063996670152846490964293480E-07)
  ( -0.559687451939794300415087491274E-08 -0.524054977191212856268975883722E-08)
  (  0.278424378484487533569335937500E-02 -0.213628518395125865936279296875E-02)

[ Last edited by 信任开花 on 2012-1-11 at 16:34 ]
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1楼 2011-11-29 22:28:05
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)
★
信任开花(金币+5):谢谢参与
信任开花(金币+1): 2011-11-30 08:32:19
信任开花(金币+4): 感谢 2011-11-30 08:32:39
In2O3，这个化学式只含有5个原子，所以单胞中原子个数应该是5或者5的倍数，故96应该是不可能的。应仔细核对。
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2楼2011-11-30 07:52:51
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信任开花

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fzx2008 at 2011-11-30 07:52:51:
In2O3，这个化学式只含有5个原子，所以单胞中原子个数应该是5或者5的倍数，故96应该是不可能的。应仔细核对。

另输出文件中：
        _atom_site_U_iso_or_equiv
        _atom_site_thermal_displace_type

版主可知道这两行表示什么意思呢，期待回答

还有就是这一行
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)
中的ITF(B)表示啥

谢谢啦
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3楼2011-11-30 08:35:02
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)
信任开花(金币+5): 感谢版主提醒 2011-12-15 20:17:01
实验测晶体结构，写成cif文件，原子位置跟温度或者跟原子本身振动有关，这些因素就体现在Uiso、ITF之类的数据中。（个人理解，仅供参考）

做DFT计算，我们就不关心这些了，只需要空间群，晶格参数，原子坐标。
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4楼2011-11-30 12:38:18
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