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gzbs

木虫 (正式写手)

[求助] 晶体A类错误请教?

如题,最近合成出以个晶体,但是有一些晶体A和B类错误,不知如何处理,请问有哪位兄弟姐妹能帮忙?
PLAT316_ALERT_2_A Too many H on C in C=N Moiety in Main Residue ..        C37      
PLAT414_ALERT_2_A Short Intra D-H..H-X       H7A    ..  H37B    ..       1.78 Ang.  
PLAT973_ALERT_2_A Large Calcd. Positive Residual Density on    Eu1       4.25 eA-3  
And 2 other PLAT973 Alerts
More ...

PLAT414_ALERT_2_B Short Intra D-H..H-X       H7B    ..  H37A    ..       1.81 Ang.  
PLAT910_ALERT_3_B Missing # of FCF Reflections Below Th(Min) .....         12 Why ?
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mt7240

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gzbs: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-11-20 08:37:49
gzbs: 金币+2 2014-01-10 17:55:20
C37加氢有问题,重新加下,第三个没遇到过,多精修几轮试试
2楼2013-11-19 16:59:37
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gzbs: 金币+2, 有帮助, 谢谢,但还不是不懂操作 2013-11-22 15:34:46
gzbs: 金币+5 2014-01-10 17:55:08
PLAT973 Type_2 Test for large positive density on metal atom
Larger than expected residual density maximum on heavy atom location.
This might be caused by unaccounted for twinning, wrongly assigned
atom types and other model errors.
Another cause may be a SHELXL 'DAMP 0 0' instruction for a non-converged
refinement.

楼主的原子指认应该是对的,这个说明的最后一句或许有点启发。
3楼2013-11-20 15:23:36
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forever1706

禁虫 (知名作家)

但是不知道该怎么检查或者操作,等高手解答。
4楼2013-11-20 15:25:52
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gzbs: 金币+3, 有帮助 2014-01-10 17:54:50
前两天在另外一个帖子里,有高手用DAMP 5000,在ins文件中,我也没弄懂是啥意思。你试试呗。
5楼2013-11-23 07:43:26
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他额儿童

新虫 (初入文坛)

第一加氢可能加错了,第二你用twin 空格 basf 0.1 的指令即可消除PLAT973之类的错误
6楼2020-12-28 02:20:50
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