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xiaojing7759

银虫 (正式写手)

[交流] 【请教】请教怎样消除这些A类错误

PLAT214_ALERT_2_A Atom O4W     (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio        82.20 prola


PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O3W    ..  O4W     ..       2.26 Ang.



PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     226.00 A**3
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1楼 2010-12-12 19:07:04
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tianjm07

木虫 (著名写手)
★
xiaojing7759(金币+1):谢谢参与
没看懂什么意思？具体是说什么的。。。。。
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2楼2010-12-12 19:26:59
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xiaojing7759

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tianjm07 at 2010-12-12 19:26:59:
没看懂什么意思？具体是说什么的。。。。。

我也没遇到过，也不懂事什么呢，(～ o ～)~zZ
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3楼2010-12-12 19:28:42
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tianjm07

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by xiaojing7759 at 2010-12-12 19:28:42:

我也没遇到过，也不懂事什么呢，(～ o ～)~zZ

那帮你顶一下，看看有没有高手知道？
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4楼2010-12-12 19:30:33
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wujinji

金虫 (正式写手)
★
xiaojing7759(金币+1):谢谢参与
xiaojing7759(金币+1):谢谢 2010-12-13 09:15:40
溶剂的模型没定好，两个氧原子相离很近
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5楼2010-12-12 19:53:07
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lanmao20

金虫 (正式写手)
★
xiaojing7759(金币+1):谢谢参与
xiaojing7759(金币+1):谢谢 2010-12-13 09:15:30
PLAT214_ALERT_2_A Atom O4W     (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio        82.20 prola
水的温度因子太大，如果确定是水，可以只修各向同性或作无序处理

PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O3W    ..  O4W     ..       2.26 Ang.

两个水分子定的有点问题，是不是无序的两个氧原子？

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     226.00 A**3
结构中可能还有未指定的原子，需要进一步修正
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6楼2010-12-12 21:09:34
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tianjm07

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by lanmao20 at 2010-12-12 21:09:34:
PLAT214_ALERT_2_A Atom O4W     (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio        82.20 prola
水的温度因子太大，如果确定是水，可以只修各向同性或作无序处理

PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O3W ...

确实牛人一个哈
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7楼2010-12-12 21:20:14
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bswk

铜虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
第一个问题可用ISOR精修   第二个问题可把两个水分子占有率减半作无序处理试试
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8楼2010-12-15 11:41:16
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