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xiaojing7759

银虫 (正式写手)

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[交流] 【请教】请教怎样消除这些A类错误

PLAT214_ALERT_2_A Atom O4W    (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio       82.20 prola

PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O3W ..  O4W    ..    2.26 Ang.

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .    226.00 A**3

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1楼 2010-12-12 19:07:04

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lanmao20

金虫 (正式写手)

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★
xiaojing7759(金币+1):谢谢参与
xiaojing7759(金币+1):谢谢 2010-12-13 09:15:30

PLAT214_ALERT_2_A Atom O4W    (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio       82.20 prola
水的温度因子太大，如果确定是水，可以只修各向同性或作无序处理

PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O3W ..  O4W    ..    2.26 Ang.

两个水分子定的有点问题，是不是无序的两个氧原子？

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .    226.00 A**3
结构中可能还有未指定的原子，需要进一步修正