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adamm

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[交流] DNA片段无法用gaussian计算？已有2人参与

大家有经验没有？

我在做AT，GC两对碱基对的DNA立体短片段的结构优化时候，出来的结果总是为圆环型，而不是阶梯型；而用力学计算的结果却大致是复合通常所见的阶梯型！

难道计算DNA电子结构的时候，只能是先用力学方法优化结构，然后直接使用此结构在使用DFT计算电子结构么？

发表的文章多是研究单个碱基，或一对碱基对的，没有看到有做DNA片段DFT计算的哦~

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1楼2013-11-15 11:28:29

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阿德

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楼主，请问你做DNA结构优化的意义在哪呀，是指什么样的结构？

[ 发自小木虫客户端 ]

2楼2013-11-26 22:16:30

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virtualzx

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你用的什么泛函？B3LYP是不行的。

3楼2013-11-27 02:27:16

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adamm

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用自己构建的简单结构，计算DNA在电场下的电荷传输等。

令问一下：B3LYP不成，可以的泛函是什么呀？看文献好像是不能用来优化，但用力学模拟后的结构却可以用这个泛函来计算的。

4楼2013-11-28 16:21:06

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