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490105179木虫 (正式写手)
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[求助]
测试晶格参数出现问题
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我根据侯博士手册上的教程测试晶格参数，因为我这提交任务需要脚本，所以将run_a0添加在我的脚本里，但是测试的结果总是少一个，请大家帮忙分析一下。先贴上脚本文件。#!/bin/sh APP_NAME=intelg_mid NP=12 NP_PER_NODE=12 RUN="RAW" CURDIR=$PWD VASP=~/bin/vasp.5.2.11-mp source /home-gg/compiler/intel/composer_xe_2011_sp1/bin/compilervars.sh intel64 source /home-gg/compiler/mpi/openmpi-1.4.4-intel.sh cd $CURDIR #start creating .nodelist rm -rf $CURDIR/nodelist >& /dev/null for i in `echo $LSB_HOSTS` do echo "$i" >> $CURDIR/nodelist done nodelist=$(cat $CURDIR/nodelist | uniq | awk '{print $1}' | tr '\n' ',') rm WAVECAR for j in 3.5 3.9 4.3 do cat > POSCAR <<! Pt $j 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 1 Direct 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 ! echo "a = $j"; mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE vasp E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }'` V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n" , $5}'` echo $V $E >> EtVo.dat # # echo -n "start time " > time date >> time mpirun -np $NP -machinefile $CURDIR/nodelist $VASP &> vasp.out echo -n "end time " >> time ; date >> time cat time >> vasp.out done # # exit |
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