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求助如何优化获得配合物不同构象的能量
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如图的这个配合物，由于配体具有一定的柔性，两个铜离子之间的距离可以有一定的调整 文献已经通过实验的方法证明了不同尺寸阴离子的距离与其结合常数之间的趋势图  而晶体数据表明，这个配合物主要有两种构象，当然这是固体状态，只能以此作为参考  我想要计算一下不同Cu...Cu间距下的比较稳定的构象，然后用不同距离的构象的能量印证别人的实验结果，然后再拿来算其他类似配合物 但是现在的问题是如果只是计算[Cu2L]4+这个配合物，中间会有一个空位，优化的时候苯环容易向中间翻转，听说可以加入稀有气体原子进行计算，但是优化之后稀有气体飞走了 还有就是是否一定要手动调整构象并fix 两个Cu的间距，能有一个步长么 先谢谢了~ [ Last edited by mcv on 2013-11-11 at 21:34 ] |
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