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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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purplesdd

金虫 (正式写手)

[求助] 离子吸附结构优化后太奇怪了!???

我想算算一个二维晶体的离子吸附情况,结构松弛后,建立的真空层消失,很奇怪!大家看看怎么回事???所用的软件是CASTEP,计算参数就是改动了charge为2。。。
离子吸附结构优化后太奇怪了!???
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离子吸附结构优化后太奇怪了!???-1
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最好的禅语是:该吃饭的时候好好吃饭,该睡觉的时候好好睡觉。
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purplesdd

金虫 (正式写手)

没人做离子吸附吗?
最好的禅语是:该吃饭的时候好好吃饭,该睡觉的时候好好睡觉。
2楼2013-11-12 08:41:02
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+3, 谢谢指导 2013-11-13 09:23:14
purplesdd: 金币+10, 有帮助 2013-11-14 10:43:16
MS 參數不會調
但 VASP 跟 MS 是好兄弟
原理差不多

在VASP裡
relaxation 有很多種選項
其中一種是 ISIF=2
指的是 unit cell 不動
裡面的原子是可以動

另一種 ISIF=3
是允許整個 unit cell 形狀體積與裡面的原子
都可以變化

你的狀況很明顯就是後者
unit cell 的形狀與體積都被改變了

我猜是在 task --> Geometry Optimization 這一欄可以調整
或是後面那個 More 裡面應該會有可調整的東西
3楼2013-11-12 20:01:01
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鹰羽龙

木虫 (著名写手)

我也做过一个二维层状材料表面吸附,上下两面一边一个吸附原子,总体是电中性的,不优化晶胞的情况下优化后中间的键直接断开了,吸附一个可以,不知何解?PS:用VASP算的
4楼2013-11-12 21:30:33
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purplesdd

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jpchou at 2013-11-12 20:01:01
MS 參數不會調
但 VASP 跟 MS 是好兄弟
原理差不多

在VASP裡
relaxation 有很多種選項
其中一種是 ISIF=2
指的是 unit cell 不動
裡面的原子是可以動

另一種 ISIF=3
是允許整個 unit cell 形狀體積與裡 ...

您说的很对,我现在猜测,离子计算的时候不能进行晶包的优化,不然就和我上图一样了,不知道想的对不对?利用B3LYP计算时候,就是这样,没有优化晶包的选项。希望多多交流!很感谢您的回帖
最好的禅语是:该吃饭的时候好好吃饭,该睡觉的时候好好睡觉。
5楼2013-11-14 10:45:22
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purplesdd

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 鹰羽龙 at 2013-11-12 21:30:33
我也做过一个二维层状材料表面吸附,上下两面一边一个吸附原子,总体是电中性的,不优化晶胞的情况下优化后中间的键直接断开了,吸附一个可以,不知何解?PS:用VASP算的

希望多交流,吸附原子和吸附离子有什么截然的不同吗?是因为离子是激发态吗?
最好的禅语是:该吃饭的时候好好吃饭,该睡觉的时候好好睡觉。
6楼2013-11-14 10:47:06
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2013-11-15 18:45:58
???????:
5?: Originally posted by purplesdd at 2013-11-14 10:45:22
???????????????????????????????о????????????????????????????????????????????B3LYP??????????????????????????????䶮?????????????л???????...

???????????????о????????????????????????????????????????
> ????
??????"?x?????"?????N?
??????f
????????????????Q???x???????
???@?e???"?x??"????????????????

??????? unit cell relaxation
?@???????y?Y??
??F???????????????????
???????????
vasp or castep ?@?N?L??????????w
?????? x,y,z ?????S?????L????????
??????f?????F???@?? thin film model
?????c???涼??????L???????? thin film
???g????????_
????????w??? cell relaxation
100% ??y???s?M?
??????? thiin film ??? bulk
????N?
??? bulk ??????^?????
????o???????????? bulk ?B
7楼2013-11-14 16:35:57
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-15 18:46:04
带有真空层的结构计算时不应该优化晶胞。和你吸附的物质是什么没有关系,这一点楼上已经解释非常清楚了。
8楼2013-11-14 18:42:37
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purplesdd

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by jpchou at 2013-11-14 16:35:57
离子计算的时候不能进行晶包的优化,不然就和我上图一样了,不知道想的对不对?
> 不對
先問一下"離子計算"是指什麼?
一般?碚f
失去或得到電子之後的原子稱為離子,對嗎
你這裡指的"離子&q ...

你的话很有道理,但是做原子吸附的时候优化之后没有变成bulk,单单将charge改为2时,优化的真空层都会消失,这个很费解,不晓得几何优化还能改变真空层的厚度。实验结果是,离子吸附会增加层间距的。castep确实和vasp计算很多相似的。希望多交流,很感谢!
最好的禅语是:该吃饭的时候好好吃饭,该睡觉的时候好好睡觉。
9楼2013-11-19 11:27:24
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匿名

本帖仅楼主可见
10楼2013-11-19 13:16:34
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