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490105179

木虫 (正式写手)

[求助] VASP运算出错

我用VASP运算分子构型,结果出现错误,请大神帮忙看一下。vasp.out内容如下:
running on   12 nodes
distr:  one band on    1 nodes,   12 groups
vasp.5.2.11 10Dec10 complex
POSCAR found type information on POSCAR  C  Si
POSCAR found :  2 types and      46 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(           1 )
WAVECAR not read
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1     0.767483003146E+03    0.76748E+03   -0.63739E+04 87840   0.102E+03
DAV:   2    -0.172322255992E+03   -0.93981E+03   -0.90127E+03113532   0.219E+02
DAV:   3    -0.291533542997E+03   -0.11921E+03   -0.11368E+03113352   0.739E+01
DAV:   4    -0.298009705960E+03   -0.64762E+01   -0.63666E+01123264   0.186E+01
DAV:   5    -0.298231263562E+03   -0.22156E+00   -0.22106E+00118896   0.314E+00    0.323E+01
DAV:   6    -0.384472756990E+03   -0.86241E+02   -0.59947E+02131916   0.445E+01    0.364E+01
DAV:   7    -0.382569362996E+03    0.19034E+01   -0.13983E+03148884   0.595E+01    0.366E+01
DAV:   8    -0.278407641613E+03    0.10416E+03   -0.67665E+02127008   0.501E+01    0.209E+01
DAV:   9    -0.268143422744E+03    0.10264E+02   -0.22030E+02115692   0.305E+01    0.158E+01
DAV:  10    -0.260609379058E+03    0.75340E+01   -0.43899E+01110232   0.132E+01    0.707E+00
DAV:  11    -0.260902669900E+03   -0.29329E+00   -0.13421E+01108276   0.611E+00    0.665E+00
DAV:  12    -0.262446345184E+03   -0.15437E+01   -0.16797E+01118332   0.535E+00    0.107E+01
DAV:  13    -0.260039597236E+03    0.24067E+01   -0.10219E+01123972   0.435E+00    0.232E+00
DAV:  14    -0.260073128111E+03   -0.33531E-01   -0.88009E-01106764   0.204E+00    0.138E+00
DAV:  15    -0.260040145997E+03    0.32982E-01   -0.49699E-01108216   0.127E+00    0.124E+00
DAV:  16    -0.260048414349E+03   -0.82684E-02   -0.37286E-01117756   0.652E-01    0.181E+00
DAV:  17    -0.260032282745E+03    0.16132E-01   -0.15360E-01126024   0.434E-01    0.122E+00
DAV:  18    -0.260022133230E+03    0.10150E-01   -0.13960E-01 99816   0.322E-01    0.343E-01
DAV:  19    -0.260025049745E+03   -0.29165E-02   -0.40661E-02113388   0.244E-01    0.433E-01
DAV:  20    -0.260023170133E+03    0.18796E-02   -0.14141E-02111096   0.153E-01    0.969E-02
DAV:  21    -0.260024246213E+03   -0.10761E-02   -0.34182E-03113340   0.891E-02    0.186E-01
DAV:  22    -0.260024817393E+03   -0.57118E-03   -0.14177E-03 87024   0.552E-02    0.109E-01
DAV:  23    -0.260026408708E+03   -0.15913E-02   -0.67147E-03 88488   0.646E-02    0.248E-01
DAV:  24    -0.260026280473E+03    0.12824E-03   -0.59323E-04 75540   0.383E-02    0.170E-01
DAV:  25    -0.260026435093E+03   -0.15462E-03   -0.45050E-04 59256   0.226E-02    0.860E-02
DAV:  26    -0.260026798611E+03   -0.36352E-03   -0.46024E-04 64164   0.246E-02    0.216E-02
DAV:  27    -0.260027218845E+03   -0.42023E-03   -0.48242E-04 61164   0.242E-02    0.821E-02
DAV:  28    -0.260027353097E+03   -0.13425E-03   -0.23281E-04 59244   0.176E-02    0.265E-02
DAV:  29    -0.260027514338E+03   -0.16124E-03   -0.92002E-05 61092   0.109E-02    0.144E-02
DAV:  30    -0.260027562177E+03   -0.47839E-04   -0.13565E-05 58560   0.678E-03
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 2 with PID 21906 on node gg1113 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------
3 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)
start time  Wed Nov  6 08:51:30 CST 2013
end   time  Wed Nov  6 23:50:45 CST 2013
在传上输入文件。[ 来自小组 计算材料学 ]
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  • 附件 1 : INCAR
  • 2013-11-07 10:36:27, 286 bytes
  • 附件 2 : KPOINTS
  • 2013-11-07 10:36:28, 91 bytes
  • 附件 3 : POSCAR
  • 2013-11-07 10:36:29, 2.87 K
  • 附件 4 : POTCAR
  • 2013-11-07 10:36:34, 448.57 K

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490105179

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2013-11-07 17:02:36
不知到你想要研究什麼
但 z 軸開這麼大的用意是....? ( 33.2205009460)
若 z 開這麼大
k 點就不要用這麼多 ( 11x11x11....)
用個 11x11x1 就很迷人了

所以我猜
是記憶體不夠
機器罷工

我想优化切面结构,原子坐标是直接拷过来的,我把K点改小点试试
3楼2013-11-07 17:13:28
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-08 07:46:31
不知到你想要研究什麼
但 z 軸開這麼大的用意是....? ( 33.2205009460)
若 z 開這麼大
k 點就不要用這麼多 ( 11x11x11....)
用個 11x11x1 就很迷人了

所以我猜
是記憶體不夠
機器罷工
2楼2013-11-07 17:02:36
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