24小时热门版块排行榜    

查看: 3514  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

姬宫千歌音

新虫 (初入文坛)

[交流] Gromacs怎么使用clayff力场? 已有5人参与

如何在Gromacs中使用clayff力场啊?
网上下载的clayff只有frc格式的。。。

另外我想把MS做的quartz.pdb导入 gromacs 生成 top时候出错。。
残基“MOL” not found。。应该怎么修改?

[ Last edited by 姬宫千歌音 on 2013-11-6 at 17:14 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

姬宫千歌音

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-06 16:34:34
不知道楼主为什么会在蛋白质软件里用到clayff

clayff推荐用MS软件的gulp模块,或者lammps

我看到很多文献是Gromacs用clayff啊。。对了使用gulp clayff计算的时候出错 Si O H not found in library是为什么?

[ Last edited by 姬宫千歌音 on 2013-11-6 at 17:26 ]
3楼2013-11-06 17:09:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-06 18:04:21
不知道楼主为什么会在蛋白质软件里用到clayff

clayff推荐用MS软件的gulp模块,或者lammps
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-11-06 16:34:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunguohui

新虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
查看相应的文献应该是最好的办法。
科研路上大家相互帮助!
4楼2013-11-06 20:05:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-07 08:17:13
你要自己写top文件
5楼2013-11-06 22:59:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +7 chengyan1220 2026-08-21 8/400 2026-08-21 15:19 by chengyan1220
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 18/900 2026-08-21 11:53 by wuchongjun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
请填处理意见