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山水88

木虫 (正式写手)

[求助] Red重组老是不成功,求救

用Red重组敲除基因,做了一个多月了,还是没有成功,前期是抗性基因片段PCR量低,后来换了酶解决了,转了pKD46之后的菌株诱导表达到OD0.6制备感受态转化PCR片段,过程应该都是比较常规的了,可是这么久就是不成功,请问有做过的指点一下,谢谢了,浪费不起时间了
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guohuayin

木虫 (著名写手)

博士,副教授

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
山水88: 金币+10 2013-11-03 17:44:04
引用回帖:
6楼: Originally posted by 山水88 at 2013-11-01 04:05:54
1、将PKD46化转到大肠杆菌中,挑取单克隆,提取质粒,初步验证后,接种至AMP培养基中30度过夜培养,次日1:50转接至新鲜培养基,培养至OD600=0.2时加入阿拉伯糖至终浓度0.2%,继续培养到OD0.6时,制备电转感受态细胞 ...

这是我能想到的解决办法:我看你做的实验,不应该是抗生素失效的问题,不过四环素抗性确实不好用,你可以给朱老师索要其他抗性质粒做个对照试试,也许就做出来了。同时我建议你检查所用的所有的实验材料,重组质粒,包括菌株是否正确,我做重组时,都是一个一个材料核实,确保重组系统没有问题,有些问题是当时我自己都没有料想到的,觉得不应该出现的问题,但是就是出错了,(比如曾经碰到重组质粒出错,抗生素失效,而这些都是问题的关键)。总之,重组碰到的问题太多,细心才能解决所有的问题。
内生菌资源和核酸分子的利用
18楼2013-11-03 01:02:17
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guohuayin

木虫 (著名写手)

博士,副教授

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 2013-11-04 08:36:13
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。
内生菌资源和核酸分子的利用
2楼2013-11-01 20:29:45
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山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuayin at 2013-11-01 20:29:45
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。

你好,看过您的帖子了,对您的工作表示惊喜。我目前的情况是抗性基因PCR片段量应该够了,感受态也是按照文献方法做的,菌株就是常用的BW25113,引物设计50+20bp,转化后在抗性平板上长的挺多的,但全是假阳性,因此想请教一下有什么需要注意或者可能会影响重组效率的步骤,谢谢!
3楼2013-11-01 21:09:04
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山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuayin at 2013-11-01 20:29:45
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。

还有一个就是,我想敲除的是三个串联基因,大小在2.5kb,应该说也不是很大了,不知道这个会有影响么。另外一个就是我使用的是四环素抗性基因片段,以前这个抗生素也没用过,所以对它的使用注意事项也不是很清楚,如果是抗性失效的话,长出假阳性也就可以理解了,但同时我做DH5a对照是没有菌落长出来的,因此重组效率不高应该是主要问题了,当然,四环素使用注意事项也烦请老师指点一二,谢谢!
4楼2013-11-01 21:17:33
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