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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 文献解析 » 文献空间群确定
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奔跑的小鸟

银虫 (初入文坛)

[求助] 文献空间群确定

小弟上传了一篇文献的两个截图，其中一个是Form I的PXRD指标化后的晶胞参数，上面给出的空间群是P21#4，但是文章上有一段话说：Form I中每个分子占的体积为1293.5A，但是P21#4群就限定了每个晶胞里面只含2个分子。根据文章计算的晶胞参数计算的晶胞体积5174.1A，文章也已给出。那每个分子占的体积应该为：
5174.1/2=2587.05，而不是1293.5A啊，这是怎么回事？
文献空间群确定
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文献空间群确定-1
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1楼 2013-10-31 17:15:09
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kuoli2010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
奔跑的小鸟: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-11-01 09:43:39
P21不是说只有两个分子，而是说晶胞里至少有两套对称性关联的原子组合。四个分子可以是AA'BB'
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2楼2013-11-01 05:13:56
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
奔跑的小鸟: 金币+5 2013-11-01 09:43:48
楼上说的是，P21有可能有4个分子，这样就满足了
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北京人
3楼2013-11-01 07:50:40
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奔跑的小鸟

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-11-01 05:13:56
P21不是说只有两个分子，而是说晶胞里至少有两套对称性关联的原子组合。四个分子可以是AA'BB'

我把文章传上来，你们看看。Form I是溶剂化合物，主要大分子是A，但是溶剂是什么因为没有单晶数据所以无法确定。只能确定主要大分子是A。那如果含四个分子的话岂不是AAAA。我用MS软件模拟晶体结构的时候让晶胞里含有4个A分子，但是重叠了。是不是他计算的分子体积有误啊
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4楼2013-11-01 09:39:48
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kuoli2010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 奔跑的小鸟 at 2013-10-31 20:39:48
我把文章传上来，你们看看。Form I是溶剂化合物，主要大分子是A，但是溶剂是什么因为没有单晶数据所以无法确定。只能确定主要大分子是A。那如果含四个分子的话岂不是AAAA。我用MS软件模拟晶体结构的时候让晶胞里含 ...

分子体积一般遵循18A^3/atom，注意要把所有的非氢原子都算进去。MS——那是另外的一个问题了。
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5楼2013-11-01 11:38:10
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奔跑的小鸟

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-11-01 11:38:10
分子体积一般遵循18A^3/atom，注意要把所有的非氢原子都算进去。MS——那是另外的一个问题了。...

麻烦能再详细一点吗？文章计算Form I中每个分子占的体积的时候就是总体积/4啊，即使按你说的：“分子体积一般遵循18A^3/atom，注意要把所有的非氢原子都算进去。”的话那也得知道每个晶胞含几个分子吧。MS难道计算有问题？还是我设置有问题？
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6楼2013-11-01 16:47:19
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kuoli2010

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 奔跑的小鸟 at 2013-11-01 03:47:19
麻烦能再详细一点吗？文章计算Form I中每个分子占的体积的时候就是总体积/4啊，即使按你说的：“分子体积一般遵循18A^3/atom，注意要把所有的非氢原子都算进去。”的话那也得知道每个晶胞含几个分子吧。MS难道计算 ...

先不考虑MS——我不知道MS算了什么，怎么算的，靠不靠谱。知道晶胞体积就可以求晶胞中非氢原子数了（~V/18），知道每个分子的非氢原子数就可以算晶胞里有几个分子了（溶剂占的比例应该比较小，不是主要问题）。现在你算完之后和空间群什么的的都对上了么？理解了么？然后你再问MS的问题，看有人懂么。在版上文问题最好一个一个的，把每个问题的背景介绍清楚。在你这个问题上你自己是唯一的专家，别人都是帮忙围观的，不可能知道所有的信息。
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7楼2013-11-01 22:19:59
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奔跑的小鸟

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-11-01 22:19:59
先不考虑MS——我不知道MS算了什么，怎么算的，靠不靠谱。知道晶胞体积就可以求晶胞中非氢原子数了（~V/18），知道每个分子的非氢原子数就可以算晶胞里有几个分子了（溶剂占的比例应该比较小，不是主要问题）。现在 ...

明白你的意思了。你是说根据晶胞体积就可以求里面的分子数目，然后与空间群对比检验空间群是否正确。按你说的计算了一下，晶胞体积/18/67(67为每个大分子所含有的非氢原子数）=4.3,真的是每个晶胞含4个大分子啊。这与空间群对不上。也就是说他的空间群确定有问题。但是我的实验数据经过模拟计算空间群是：P21#4或者是P21/M，但是P21/M空间群大分子会重叠，你怎么看待这事啊。谢谢你的建议，让我明白了很多。
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8楼2013-11-02 09:39:37
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kuoli2010

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 奔跑的小鸟 at 2013-11-01 20:39:37
明白你的意思了。你是说根据晶胞体积就可以求里面的分子数目，然后与空间群对比检验空间群是否正确。按你说的计算了一下，晶胞体积/18/67(67为每个大分子所含有的非氢原子数）=4.3,真的是每个晶胞含4个大分子啊。这 ...

P21也可以含4个分子啊，两两等价——就是说两个站着两个坐着，两个站着的通过21轴关联，坐着的也是。
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9楼2013-11-02 21:58:04
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奔跑的小鸟

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-11-02 21:58:04
P21也可以含4个分子啊，两两等价——就是说两个站着两个坐着，两个站着的通过21轴关联，坐着的也是。...

明白了，已经模拟出来了，谢谢你
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10楼2013-11-06 09:32:46
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