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liujodan

木虫 (正式写手)

[求助] MS建立Co3O4模型

各位大侠:
    小弟在用MS建立Co3O4时遇到问题,从小木虫中查的ICSD参数,建立模型后,发现与文献不一致,不知道是自己模型不对还是怎么回事,请大家帮忙看看,谢谢啦!

*data for   ICSD #27497
Coll Code   27497
Rec  Date   1980/01/01
Mod  Date   1984/04/05
Chem Name   Tricobalt Tetraoxide
Structured  Co3 O4
Sum         Co3 O4
ANX         AB2X4
D(calc)     6.1
Title       The magnetic structure of Co3 O4
Author(s)   Roth, W.L.
Reference   Journal of Physics and Chemistry of Solids
            (1964), 25, 1-10
Unit Cell   8.065 8.065 8.065 90. 90. 90.
Vol         524.58
Z           8
Space Group F d -3 m S
SG Number   227
Cryst Sys   cubic
Pearson     cF56
Wyckoff     e d a
Red Cell    F  5.702 5.702 5.702 60 60 60 131.145
Trans Red   0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500
Comments    Mixed Valence compound for Co
            Structure type : Al2MgO4
            No R value given in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
Co   1  +2    8 a   0           0           0              1.         0           0.214
Co   2  +3    16 d  0.625       0.625       0.625          1.         0           0.214
O    1  -2    32 e  0.388       0.388       0.388          1.         0           0.214
*end for    ICSD #27497

第一图为我建立模型图,第二图为文献图,差距挺大。
MS建立Co3O4模型
27497.JPG


MS建立Co3O4模型-1
复件 2013-10-18_171820.JPG
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liujodan

木虫 (正式写手)

第一图中,红色为氧原子 蓝色为Co
2楼2013-10-22 09:50:59
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-21 16:54:21
Title       The magnetic structure of Co3 O4
Author(s)   Roth, W.L.
Reference   Journal of Physics and Chemistry of Solids
             (1964), 25, 1-10



如果楼主看的文献不是这篇的话,不对 ...

多谢,多谢,我看的是

Xiang-Lan Xu, Zhan-Hong Chen , Yi Li , Wen-Kai Chen , Jun-Qian Li ,*
Bulk and surface properties of spinel Co3O4 by density functional calculations, Surface Science 603 (2009) 653–658.

但是大部分文献中Co3O4结构都和这个文献一样。我要是选取一个奇怪的,编辑也会奇怪的。
6楼2013-10-22 15:09:35
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-21 17:13:28
楼主试试这个晶胞参数吧。。

N * -CoCo2O4- Liu, X.;Prewitt, C.T.(1990)
8.177300 8.177300 8.177300 90.000000 90.000000 90.000000
Co1    0.000000 0.000000 0.000000 0.000000
Co2    0.625000 0.62500 ...

这个ICSD号是多少呢?可否帮忙建立一下,发个截图,我也建立一个,做个比较
7楼2013-10-22 15:13:13
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by liujodan at 2013-10-21 19:13:13
这个ICSD号是多少呢?可否帮忙建立一下,发个截图,我也建立一个,做个比较...

变化不大
MS建立Co3O4模型-2
2013-10-22_151942.jpg

9楼2013-10-22 15:31:29
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-21 19:24:37
晶胞你自己建吧 我也不知道你要哪个方向看

来源参数什么的都有

...

下楼是我根据您提供的参数建的,不知是否正确
10楼2013-10-22 15:32:54
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-21 20:12:07
你确定用的是FD-3M空间群?

...

您建立的模型和文献一致,是用MS建立的吧?能否将输出模型发我一下?我学习一下,buct200908015@163.com,非常感谢!
14楼2013-10-23 08:41:31
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by chenyuchen at 2013-10-22 04:56:53
你自己建的结构明显错了,这个材料和Fe3O4一样就得有CoO四面体和八面体,应该是你坐标系选的不对,vesta用你的参数得到的结构和你给的图2一致。

您采用的参数是我1楼写的那个吗?
15楼2013-10-23 08:44:12
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-21 20:12:07
你确定用的是FD-3M空间群?

...

问题找到了,多谢了,主要是在坐标选择上出了点问题,不应该选笛卡尔坐标,应该选 fractional,多谢啦!!
16楼2013-10-23 09:14:55
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liujodan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by pigrass at 2013-10-22 13:18:05


晕。。。居然不知道那是分数坐标。。。

呵呵,是啊,小弟刚学这个。。。很多都不太懂
18楼2013-10-23 09:21:50
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