应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS 建团簇模型
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1763  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yhailing

银虫 (正式写手)

[求助] MS 建团簇模型

打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周期性，然后手动删到不要的原子。不知道这样做有什么问题没。在提出原子坐标时，CASTEP无法计算，好像是和去掉了周期性有关。使用了Dmol3计算，但是和CASTEP不一样，输出的不是.cell文件，而是.CAR文件.不知道怎么转换为POSCAR文件。

也有说是加真空层的，但是我试了一下，真空层只能加一个方向，其余几个方向会不会有点问题。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-16 09:27:25
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
补充一下，我做的只需要一个孤立的团簇即可。
赞一下 回复此楼
2楼2011-05-16 09:32:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiao85

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:18
yhailing(金币+2): 感谢回帖，我后来用跟这个类似的方法，就是把晶格中周围原子去掉，剩下中间小部分，但是计算显示很难收敛。 2011-05-24 12:36:39
yhailing(金币+5): 感谢！ 2011-05-25 09:03:08
可不可以先建一个大的体包，然后切割成团簇，也就是把体胞中多余的原子去掉
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己一定会成功！！
3楼2011-05-23 09:02:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:36
gzqdyouxia(金币+7): 替楼主转送 2011-05-27 17:20:58
引用回帖:
Originally posted by yhailing at 2011-05-16 09:27:25:
打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周 ...

MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。
赞一下(2人) 回复此楼
我与我纠缠久
4楼2011-05-23 10:11:03
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 漂泊四方 at 2011-05-23 10:11:03:
MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。

好的，感谢！试一下先！
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-24 13:04:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yhailing 的主题更新
51/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600，320分求调剂 +16 大馋小子 2026-04-04 17/850 2026-04-06 07:58 by MOF_Catal
[考研] 机械专硕274求调剂，不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 7/350 2026-04-05 23:20 by chyhaha
[考研] 272分求调剂 +4 wangyile2233 2026-04-02 4/200 2026-04-05 22:21 by 286640313
[考研] 一志愿青科085500，初试295分，公共课213分 +3 遇到的人愿望都� 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:45 by 蓝云思雨
[考研] 296求调剂 +3 汪！？！ 2026-04-05 5/250 2026-04-05 17:38 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂，一志愿郑州大学材料与化工专硕，英二数二342分，求老师收留 +18 v12abo 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 11:37 by a8144223
[考研] 调剂 +11 JLLLLLLLLLL 2026-04-03 11/550 2026-04-04 22:21 by hemengdong
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
[考研] 材料调剂 +10 懒羊羊轻置玉臀 2026-04-02 11/550 2026-04-04 21:56 by laoshidan
[考研] 环境285分，过六级，求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +3 上海大学346调剂 2026-04-03 3/150 2026-04-04 20:20 by dongzh2009
[考研] 349求调剂 +11 zwjjjjjj 2026-03-31 11/550 2026-04-04 19:52 by 蓝云思雨
[考研] 265求调剂 +17 林深温澜 2026-04-01 20/1000 2026-04-04 01:09 by userper
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +39 洛神哥哥 2026-03-31 41/2050 2026-04-03 21:51 by qlm5820
[考研] 一志愿重庆大学085404，总分314分，求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 08工科275分求调剂 +14 AaAa7420 2026-03-31 14/700 2026-04-03 11:13 by cocolv
[考研] 08开头看过来！！！ +4 wwwwffffff 2026-03-31 6/300 2026-04-02 11:42 by 均值回归
[考研] 本2一志愿C9-333分，材料科学与工程，求调剂 +9 升升不降 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:01 by 无际的草原
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭