应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS 建团簇模型
51/1返回列表
查看: 2173  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yhailing

银虫 (正式写手)

[求助] MS 建团簇模型

打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周期性，然后手动删到不要的原子。不知道这样做有什么问题没。在提出原子坐标时，CASTEP无法计算，好像是和去掉了周期性有关。使用了Dmol3计算，但是和CASTEP不一样，输出的不是.cell文件，而是.CAR文件.不知道怎么转换为POSCAR文件。

也有说是加真空层的，但是我试了一下，真空层只能加一个方向，其余几个方向会不会有点问题。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-16 09:27:25
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
补充一下，我做的只需要一个孤立的团簇即可。
赞一下 回复此楼
2楼2011-05-16 09:32:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiao85

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:18
yhailing(金币+2): 感谢回帖，我后来用跟这个类似的方法，就是把晶格中周围原子去掉，剩下中间小部分，但是计算显示很难收敛。 2011-05-24 12:36:39
yhailing(金币+5): 感谢！ 2011-05-25 09:03:08
可不可以先建一个大的体包，然后切割成团簇，也就是把体胞中多余的原子去掉
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己一定会成功！！
3楼2011-05-23 09:02:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:36
gzqdyouxia(金币+7): 替楼主转送 2011-05-27 17:20:58
引用回帖:
Originally posted by yhailing at 2011-05-16 09:27:25:
打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周 ...

MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。
赞一下(2人) 回复此楼
我与我纠缠久
4楼2011-05-23 10:11:03
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 漂泊四方 at 2011-05-23 10:11:03:
MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。

好的，感谢！试一下先！
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-24 13:04:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yhailing 的主题更新
51/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:12 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:00 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:57 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:45 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:37 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:00 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 14:57 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 12:35 by 40ms4Wlo4umh
[基金申请] 求教各位大神：2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀？ +5 云宴山人 2026-09-10 7/350 2026-09-14 12:11 by ecnu2013
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 10:11 by 23jxep3nCNZb
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 10:01 by 23jxep3nCNZb
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 面上有专家说实验设备不是我们单位的 +6 zj_muchong 2026-09-08 8/400 2026-09-11 06:56 by suifengdao
[有机交流] 科研求助 10+4 我吃一只鱼 2026-09-07 4/200 2026-09-10 08:32 by 0940628
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭