应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS 建团簇模型
51/1返回列表
查看: 2148  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yhailing

银虫 (正式写手)

[求助] MS 建团簇模型

打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周期性，然后手动删到不要的原子。不知道这样做有什么问题没。在提出原子坐标时，CASTEP无法计算，好像是和去掉了周期性有关。使用了Dmol3计算，但是和CASTEP不一样，输出的不是.cell文件，而是.CAR文件.不知道怎么转换为POSCAR文件。

也有说是加真空层的，但是我试了一下，真空层只能加一个方向，其余几个方向会不会有点问题。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-16 09:27:25
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
补充一下，我做的只需要一个孤立的团簇即可。
赞一下 回复此楼
2楼2011-05-16 09:32:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiao85

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:18
yhailing(金币+2): 感谢回帖，我后来用跟这个类似的方法，就是把晶格中周围原子去掉，剩下中间小部分，但是计算显示很难收敛。 2011-05-24 12:36:39
yhailing(金币+5): 感谢！ 2011-05-25 09:03:08
可不可以先建一个大的体包，然后切割成团簇，也就是把体胞中多余的原子去掉
赞一下(1人) 回复此楼
相信自己一定会成功！！
3楼2011-05-23 09:02:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 15:31:36
gzqdyouxia(金币+7): 替楼主转送 2011-05-27 17:20:58
引用回帖:
Originally posted by yhailing at 2011-05-16 09:27:25:
打算用MS建一个ZnO的小颗粒模型，然后用VASP计算，希望得到表面的信息。请教各位大神，如何在建一个小颗粒团簇模型，只需50个原子即可。

PS：我现在首先输入物质模型，切了一下表面，接着生成supercell，去掉周 ...

MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。
赞一下(2人) 回复此楼
我与我纠缠久
4楼2011-05-23 10:11:03
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhailing

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 漂泊四方 at 2011-05-23 10:11:03:
MS 转 VASP输入文件有两种方式


笛卡尔坐标的话，你从CAR文件里面直接拷贝就可以了。
分数坐标，从CASTEP的输入文件里面*.cell去找，什么单胞大小，原子位置全都有。
当然之前你要弄明白POSCAR的格式。

好的，感谢！试一下先！
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-24 13:04:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yhailing 的主题更新
51/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:14 by l0VvVHGBGRLv
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +8 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:40 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 29号明天会评吗 +3 笨笨唐 2026-08-28 3/150 2026-08-30 09:29 by cww8181
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 05:40 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 13/650 2026-08-30 05:38 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:45 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭